碧云天生产的E. coli DNA Ligase,即大肠杆菌DNA连接酶,由碧云天自主研发的PerfectProtein™技术平台表达、纯化获得的重组酶。E. coli DNA Ligase是一种以NAD+ (烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)为辅酶,Mg2+依赖的,催化双链DNA中5'磷酸和3'羟基之间形成磷酸二酯键,即催化双链DNA粘性末端连接或双链DNA中的缺刻修复的DNA连接酶[1]。
E. coli DNA Ligase可催化双链DNA相邻粘性末端5'磷酸和3'羟基磷酸二酯键的形成,但常规条件下不能进行平末端双链DNA的连接。在添加10-15% PEG和适当高浓度的单价阳离子时,也可以催化平末端双链DNA的连接反应。E. coli DNA Ligase在一定温度范围内(4-37℃)均具有活性,同时可以被热失活(65℃孵育20分钟)。
碧云天生产的E. coli DNA Ligase连接粘性末端双链线性DNA的效果请参考图1:
图1. 碧云天生产的E. coli DNA Ligase连接粘性末端双链线性DNA的效果图。利用碧云天生产的BeyoFusion™ DNA Polymerase (D7220),使用两端带有Hind III酶切位点的引物对靶基因进行PCR扩增,生成两种不同长度的两端带有HindⅢ酶切位点的平末端双链线性DNA分子(900bp和600bp),随后使用碧云天Hind III (D6389)对PCR产物进行酶切,获得两端带有互补粘性末端的双链线性DNA分子,分别作为Substrate 1 (900bp)和Substrate 2 (600bp);在20µl反应体系(30mM Tris-HCl, 4mM MgCl2, 1mM DTT, 26μM NAD, 50μg/ml BSA, PH8.0 @25℃)中,分别加入400ng经PCR扩增及Hind III酶切产生的两种双链DNA片段,以及图中指定量的本产品或N公司(Competitor)的E. coli DNA Ligase,16℃孵育30分钟进行连接,然后65℃孵育20分钟以终止反应。取出10μl反应产物,加入2μl 6X DNA Loading Buffer (D0071),然后进行2%琼脂糖凝胶电泳检测。如图所示,本产品与N公司的产品相比,具有相当的连接粘性末端双链线性DNA的效果。实际操作时不同实验条件获得的实验结果会略有差异,图中所示结果仅供参考。
用途:粘性末端双链DNA分子的连接;双链DNA的缺刻修复;cDNA第二链合成后的克隆[2]。
来源:纯化自携带编码E. coli DNA ligase的E. coli重组菌株。
活性定义:One unit is defined as the amount of enzyme required to give 50% ligation of HindIII fragments of λ DNA (5' DNA termini concentration of 0.12μM, 300μg/ml) in a total reaction volume of 20μl in 30 minutes at 16℃ in 1X E. coli DNA Ligase Reaction Buffer。
纯度:不含除E. coli DNA Ligase之外的其它种类的DNA连接酶,不含内切酶和外切酶,不含RNA酶,不含磷酸酯酶。
酶储存液:10mM Tris-HCl, 50mM KCl, 1mM DTT, 0.1mM EDTA, 200µg/ml BSA, 50% Glycerol (pH7.4 @25℃)。
10X Reaction Buffer: 300mM Tris-HCl, 40mM MgCl2, 260μM NAD, 10mM DTT, 500μg/ml BSA (pH8.0 @25℃)。
失活或抑制:65℃孵育20分钟可使E. coli DNA Ligase失活。
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D7016S-1 | E. coli DNA Ligase (10U/μl) | 20µl |
D7016S-2 | 10X Reaction Buffer | 100µl |
- | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D7016M-1 | E. coli DNA Ligase (10U/μl) | 100µl |
D7016M-2 | 10X Reaction Buffer | 500µl |
- | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D7016L-1 | E. coli DNA Ligase (10U/μl) | 500µl |
D7016L-2 | 10X Reaction Buffer | 2ml |
- | 说明书 | 1份 |
-20℃保存,两年有效。10X Reaction Buffer建议长期保存于-80℃,以延长NAD半衰期。
注意事项:E. coli DNA Ligase需要以NAD (烟酰胺腺嘌呤二核苷酸) 作为辅酶,而不是像T4 DNA连接酶等以ATP为辅酶。
E. coli DNA Ligase对于平末端片段的连接效率是极低的,对于平末端的连接建议使用T4 DNA Ligase。
E. coli DNA Ligase的催化底物是双链DNA分子,不能用于单链DNA或RNA的连接反应。
E. coli DNA Ligase连接反应需要以NAD作为辅助因子,10X Reaction Buffer中含有辅助因子NAD,因此10X Reaction Buffer建议长期保存于-80℃,以延长NAD半衰期。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
Reagent | Volume | Final Concentration |
dsDNA | xμl | up to 0.25μg/μl |
10X Reaction Buffer | 2μl | 1X |
E. coli DNA Ligase (10U/μl) | 1μl | 0.5U/μl |
Nuclease-free Water | (17-x)μl | - |
Total Volume | 20μl | - |