碧云天的人基因开放阅读框(ORF)库(Human Open Reading Frame library)包含约15,000个人基因ORF克隆,其中包括已知的基因约12,000种。本人基因ORF库的每一种质粒都来自于单克隆,并且每一个ORF都经过了测序验证。后续使用Gateway系统或PCR反应即可非常方便地克隆目的基因到新的表达载体中。
本人基因ORF库的克隆在供体载体(Donor vector) pDONR223中,其图谱如图1所示。
图1. pDONR223质粒图谱。 pDONR223的全序列信息:pDONR223-seq.txt。
ORF克隆是指起始密码子和终止密码子之间的编码序列,而不包含mRNA的5'和3'端的非编码区(untranslated region, UTR)。本ORF库是通过mRNA反转录获得的编码蛋白质的cDNA,再通过Gateway技术的BP重组反应克隆到pDONR223载体中得到入门载体,其重组位点的序列如图2所示。为了便于后续利用Gateway系统添加适当的3'标签,所有的克隆都无终止密码子。在碧云天的人基因ORF库中,每一个克隆都代表一个独立的插入序列,随机挑取克隆测序,准确率为95%,但较长基因克隆准确率略差。
图2. ORF两侧的重组序列
碧云天的人基因ORF库提供的是含有相应ORF质粒的大肠杆菌甘油菌(DH5α),本产品一套共169块96孔板。克隆载体为pDONR223,载体抗性spectinomycin,推荐使用终浓度为50μg/ml。正向测序M13F引物序列为GTAAAACGACGGCCAGT,反向测序T7引物序列为TAATACGACTCACTATAGG。
人基因开放阅读框(ORF)库基因清单:请参考碧云天网站上本产品的相关信息。
包装清单:
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
T0208 | 人基因开放阅读框(ORF)库 | 1套 |
— | 说明书 | 1份 |
保存条件:
-20℃保存,二年有效。-80℃保存,五年有效。
注意事项:
pDONR223载体不能直接在细菌或哺乳动物细胞中表达相应蛋白,需要重新克隆至相应表达载体才能表达。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
使用说明:
1.根据所需人基因ORF的名称,查询并选取相应的96孔板及孔进行菌种的接种培养。
a.划平板随后挑取单克隆培养:取出对应的96孔板置于冰上,并在超净台内进行后续操作。等菌液稍融化,撕开封口膜,并小心揭开96孔板盖,注意不要交叉污染。按照如下方法之一划平板接种,随后挑取单克隆接种到含抗生素的LB中培养。
(a)用镊子和塑料枪头操作:镊子的顶端在70%酒精中蘸一下,并且在酒精灯上略略烧一下,使镊子的顶端处于无菌状态。用镊子夹取一个无菌的200微升塑料枪头,蘸取少量DH5α甘油菌,然后把蘸有菌液的塑料枪头,以尽量和LB平板接近平行的角度,在含50μg/ml spectinomycin的LB平板上连续作S形或Z形划动,再用一无菌的200微升塑料枪头,在原先的划线上以90或120度角,再在LB平板上连续作S形或Z形划动。通常换枪头重复操作2-3次即可。37℃倒置培养过夜。
(b)用接种环操作:将接种环在酒精灯上略略烧一下,使接种环处于无菌状态。微冷后,蘸取少量DH5α甘油菌,在含50μg/ml spectinomycin LB平板上连续作S形或Z形划动。把接种环再烧一下,微冷后,在原先的划线上以90或120度角,再在LB平板上连续作S形或Z形划动。通常用接种环重复操作2-3次即可。37℃倒置培养过夜。
b.直接培养:取出对应的96孔板置于冰上,并置于超净台内,后续操作都在超净台内操作。把镊子的顶端在70%酒精中蘸一下,并且在酒精灯上略略烧一下,使镊子的顶端处于无菌状态。用镊子夹取一个无菌的塑料枪头或牙签,蘸取少量DH5α甘油菌,然后把蘸有菌液的塑料枪头或牙签放到装有3毫升含50μg/ml spectinomycin 的LB细菌培养试管内或装有100毫升或更大体积LB的细菌培养瓶内。37℃,约200rpm培养过夜。
2.对于培养的菌液进行质粒的小量、中量或大量抽提。
3.重组或PCR克隆:人基因ORF库的每一个蛋白质编码序列两端有特异的重组序列。通过LR重组反应可以将ORF转移到特定接收载体中,例如Gateway系统的pDEST系列载体等,从而使目的基因在大肠杆菌、酵母、昆虫细胞或哺乳细胞等中表达;也可以此ORF库作为模板用PCR或其它常规方法克隆到其它蛋白表达载体中用于在细菌、酵母、昆虫细胞或哺乳动物细胞等中的表达。