碧云天生产的Pyrophosphatase, Inorganic (yeast),中文名为酵母无机焦磷酸酶,是由碧云天自主研发的PerfectProtein™技术平台通过大肠杆菌表达、纯化获得的可用于催化无机焦磷酸盐(Inorganic pyrophosphate, PPi)水解为正磷酸盐(Orthophosphate)的高品质重组酶。
多种代谢反应会产生无机焦磷酸,Pyrophosphatase, Inorganic (yeast)可水解无机焦磷酸盐,从而可以避免无机焦磷酸对反应的抑制,促使反应向正向进行,从而常用于RNA体外转录、DNA复制和扩增如HDA或LAMP等温扩增等产生无机焦磷酸反应体系中促进正向反应,提高反应产物的产量。
Pyrophosphatase, Inorganic (yeast)是一种金属蛋白酶(Metalloprotease),其催化的反应参考图1。该酶的活性受二价金属离子的影响,Mg2+、Zn2+、Co2+、Mn2+、Ca2+均可以提高其催化活性,在Mg2+存在的条件下活性最高[1]。
图1.Pyrophosphatase, Inorganic (yeast) (酵母无机焦磷酸酶)催化的PPi + H2O → 2Pi反应。
碧云天生产的Pyrophosphatase, Inorganic (yeast)对焦磷酸钠的水解效果请参考图2。
图2.碧云天生产的Pyrophosphatase, Inorganic (yeast)与国外N公司(Competitor N)的Pyrophosphatase, Inorganic (yeast)对焦磷酸钠的水解效果对比图。利用碧云天焦磷酸酶活性检测试剂盒(P0336)检测焦磷酸钠水解所产生的磷酸。将碧云天与N公司的Pyrophosphatase, Inorganic (yeast) (0.1U/μl)分别稀释400、500、667、1000、2000倍,然后配制100μl反应体系:100mM Tris-HCl (pH7.2), 2mM MgCl2, 0.1mM焦磷酸钠, 1μl上述不同稀释度的Pyrophosphatase, Inorganic (yeast)或Storage (Dilution) Buffer,25ºC孵育10分钟。样品孵育期间,将5mM磷酸盐标准品用双蒸水稀释至0、2.5、5、10、20、30、40、50μM。将Malachite Green Reagent A和Malachite Green Reagent B按照体积比2:1混合(现配现用),即为显色剂。96孔板(FPT011)每孔中加入200μl不同浓度的磷酸盐标准品或样品(100μl反应液+100μl水),每孔加入70μl显色剂,用移液器轻轻吹打混匀,室温静置30分钟,用酶标仪测定波长630nm的吸光度。根据磷酸盐标准品的浓度和A630数值,绘制标准曲线,根据标准曲线计算出样品中所产生的磷酸根浓度,进而计算磷酸根的生成速率。Pyrophosphatase, Inorganic (yeast)的测活数据来自三次独立重复实验。碧云天生产的Pyrophosphatase, Inorganic (yeast)与N公司的产品相比,对焦磷酸钠具有基本一致的水解效果。图中数据仅供参考,不同实验条件下获得的数据会有一定的差异。
碧云天生产的Pyrophosphatase, Inorganic (yeast)对体外转录的影响请参考图3。
图3.碧云天生产的Pyrophosphatase, Inorganic (yeast)对体外转录的影响。利用碧云天T7 Quick High Yield RNA Transcription Kit (R7016)进行RNA体外转录。配制20μl反应体系:7μl Nuclease-free Water, 1.5μl 10X T7 Reaction Buffer (终浓度为0.75X), 6μl NTP Mix, 2μl Template DNA (终浓度为0.05μg/ml), 0.5μl RNase Inhibitor, 2μl T7 RNA Polymerase, 1μl Pyrophosphatase, Inorganic (yeast)或Storage Buffer (酶量为0U, 0.001U, 0.01U, 0.1U, 0.3U, 0.5U)。37ºC孵育2.5小时,然后向反应体系中加入80μl Nuclease-free Water和1μl DNase Ⅰ,混匀后37ºC孵育15分钟,使模板DNA降解。取90μl反应液,与90μl Nuclease-free Water和20μl 3M NaAC混匀,再加入200μl苯酚/氯仿混合液(苯酚:氯仿=1:1),充分混匀,4ºC, 12000rpm离心15分钟。将上清与2.5倍体积的无水乙醇混合,-80 ºC沉淀过夜,使RNA析出。4ºC, 12000rpm离心20分钟,弃上清,用500μl 70%乙醇洗涤沉淀一次,晾干,使乙醇挥发。用50μl Nuclease-free Water溶解沉淀。将15μl甲醛、4μl loading和2μl样品混合,70ºC加热10分钟后进行跑胶。得到的RNA转录产物的长度为175nt。实验发现,加入Pyrophosphatase, Inorganic (yeast)后,转录产物的量约为对照组的2-3倍。
用途:体外转录反应中,可提高RNA的合成量[2];DNA聚合反应中,防止无机焦磷酸盐积累;利用焦磷酸盐测定法进行SNP基因分型的试剂中去除焦磷酸污染[3]。
来源:由大肠杆菌表达,表达基因为酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的ppa基因。
分子量:约33kDa。
活性定义:One unit is the amount of enzyme that will generate 1µmol of phosphate per minute from inorganic pyrophosphate under standard reaction conditions (a 10 minute reaction at 25℃ in 100mM Tris-HCl (pH7.2), 2mM MgCl2 and 2mM PPi in a reaction volume of 0.5ml)。
纯度:不含DNA内切酶和外切酶,不含RNA酶。
Storage (Dilution) Buffer:20mM Tris-HCl (pH8.0), 100mM KCl, 0.1mM EDTA, 1mM DTT, 50% (v/v) glycerol.
10X Reaction Buffer: 1M Tris-HCl (pH7.2), 20mM MgCl2.
失活或抑制:Pyrophosphatase, Inorganic (yeast)的活性可以被EDTA强烈抑制;亚胺二磷酸盐(Imidodiphosphate)、α,ω-glycol disphosphates、methanedial diphosphate和1,2-ethanedial diphosphate也是Pyrophosphatase, Inorganic (yeast)的抑制剂。加热不能使该酶完全失活,可通过柱纯化或酚/氯仿抽提的方法去除Pyrophosphatase, Inorganic (yeast)。
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R7025S-1 | Pyrophosphatase, Inorganic (yeast) (0.1U/μl) | 100μl |
R7025S-2 | 10X Reaction Buffer | 100μl |
R7025S-3 | Storage (Dilution) Buffer | 1ml |
R7025S-4 | 100mM Na4P2O7 | 100μl |
— | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R7025M-1 | Pyrophosphatase, Inorganic (yeast) (0.1U/μl) | 500μl |
R7025M-2 | 10X Reaction Buffer | 500μl |
R7025M-3 | Storage (Dilution) Buffer | 5ml |
R7025M-4 | 100mM Na4P2O7 | 100μl |
— | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R7025L | Pyrophosphatase, Inorganic (yeast) (1U/μl) | 200μl |
— | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R7025XL | Pyrophosphatase, Inorganic (yeast) (1U/μl) | 1ml |
— | 说明书 | 1份 |
-20℃保存,至少两年有效。
注意事项:酶使用时宜存放在冰盒内或冰浴上,使用完毕后宜立即放置于-20℃保存。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
Reagent | Control | Sample | ||
Volume | Final Concentration | Volume | Final Concentration | |
Ultrapure Water | 89μl | - | 88μl | - |
10X Reaction Buffer | 10μl | 1X | 10μl | 1X |
10mM Na4P2O7 | 1μl | 0.1mM | 1μl | 0.1mM |
Pyrophosphatase, Inorganic (yeast) (Diluted) | - | - | 1μl | 0.5-2.5mU/ml |
Total volume | 100μl | - | 100μl | - |
Pi (μM) | 0 | 2.5 | 5 | 10 | 20 | 30 | 40 | 50 |
50μM Pi (μl) | 0 | 10 | 20 | 40 | 80 | 120 | 160 | 200 |
Ultrapure Water (μl) | 200 | 190 | 180 | 160 | 120 | 80 | 40 | 0 |
Total Volume (μl) | 200 | 200 | 200 | 200 | 200 | 200 | 200 | 200 |