碧云天生产的5’ DNA/RNA Adenylase,即5'端DNA/RNA腺苷酰化酶,也称Single-Strand Nucleic Acid 5' Adenylase或单链核酸5'端腺苷酰化酶,可以催化5'端磷酸化的单链DNA或单链RNA (pDNA or pRNA)转换生成5'端腺苷酰化DNA (AppDNA)或5'端腺苷酰化RNA (AppRNA)。无论作为底物的DNA或RNA的3'端是否进行了氨基化等封闭,使用本产品都可以高效催化产生5'端腺苷酰化产物。在反应体系中不存在ATP的条件下,本产品还可以催化5'端磷酸化的单链DNA (pDNA)生成环状DNA (circular DNA)。
5' DNA/RNA Adenylase进行5'端腺苷酰化修饰反应时,需要ATP和待腺苷酰化修饰的5'端磷酸化的单链DNA或单链RNA。
5' DNA/RNA Adenylase催化单链核酸5'端腺苷酰化反应的原理如下:以5'端磷酸化的单链DNA或单链RNA为底物,本产品首先将ATP分解成AMP和PPi,接着AMP转移到单链DNA或单链RNA的5'磷酸基团上,之后形成腺苷酰化单链DNA或单链RNA,从而生成腺苷酰化产物。
碧云天生产的5' DNA/RNA Adenylase催化5'端磷酸化的单链DNA (pDNA)生成腺苷酰化DNA (AppDNA)的效果请参考图1。
图1.碧云天生产的5' DNA/RNA Adenylase催化5'端磷酸化的单链DNA (pDNA)转化成腺苷酰化DNA (AppDNA)的效果图。在20µl反应体系中加入5µM pDNA,0.1mM ATP,图中指定量的5' DNA/RNA Adenylase (5' DNA/RNA adenylase),65℃分别孵育1h和2h,反应完毕后85℃孵育5min以终止反应。然后每个样品各取1.5µl反应产物,加入2µl 6X DNA Loading buffer,补足水至最终体积为12µl,95℃孵育5min,随后立即冰浴放置,变性聚丙烯酰胺凝胶(15%,7M尿素)进行凝胶电泳分析。如图所示,反应进行1h需要100U的5' DNA/RNA Adenylase可以将5'端磷酸化单链DNA充分转化成腺苷酰化单链DNA;而反应进行2h则只需要50U的5' DNA/RNA Adenylase就可以将5'端磷酸化单链DNA充分转化成腺苷酰化单链DNA。
用途:制备5'端腺苷酰化的单链DNA接头,最终用于miRNA等3'端为羟基的RNA或3'端为羟基的单链DNA在克隆、高通量测序建库或PCR检测等时,在3'端添加的接头。
来源:来源于嗜热菌的腺苷酰化酶基因在大肠杆菌中进行表达纯化而获得。
活性定义:One unit is the amount of enzyme required to catalyze the transfer of 1pmol of AMP to pDNA substrate in a total reaction volume of 20μl in 15 minutes at 65℃.
纯度:不含DNA内切酶和外切酶,不含核糖核酸酶。
失活或抑制:85℃加热5min可使5' DNA/RNA Adenylase失活。
反应体系为20μl时,本产品的3kU和15kU包装分别可以进行40次和200次的5'端DNA/RNA腺苷酰化反应。
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R0719S-1 | 5' DNA/RNA Adenylase (75U/µl) | 40µl |
R0719S-2 | 10X Adenylase Reaction Buffer | 100µl |
- | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R0719M-1 | 5' DNA/RNA Adenylase (75U/µl) | 200µl |
R0719M-2 | 10X Adenylase Reaction Buffer | 500µl |
- | 说明书 | 1份 |
-20℃保存,至少2年有效。
注意事项:底物单链DNA或单链RNA的5'端磷酸化是必须的,3'端可以进行氨基化等封闭,也可以不封闭;不进行3'端氨基化等封闭时,建议将ATP的浓度增加至0.5mM,可以避免底物发生环化或串联反应。
5' DNA/RNA adenylase不能连接双链DNA (dsDNA)之间的缺刻。
5' DNA/RNA adenylase的最佳反应温度为65℃,并且在25℃时会出现去腺苷酰化现象,因此反应完成后推荐在85℃孵育5min以失活5' DNA/RNA adenylase。如果没有充分失活5' DNA/RNA adenylase,后续经历室温温度条件时,会导致腺苷酰化比例下降。
5' DNA/RNA adenylase使用时宜存放在冰盒内或冰浴上,使用完毕后宜立即放置于-20℃保存。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
Reagent | Volume | Final Concentration |
Water (DNase/RNase free) | 14µl | - |
ssDNA or ssRNA (100µM) | 1µl | 5µM |
10X Adenylase Reaction Buffer | 2µl | 1X |
ATP (1mM) | 2µl | 0.1mM |
5' DNA/RNA adenylase (75U/µl) | 1µl | 3.75U/µl |
Total Volume | 20µl | - |