碧云天生产的5'DNA Adenylation Kit,即5'DNA腺苷酰化试剂盒,是一种非常便捷和高效的通过酶学方法将单链DNA (ssDNA) 5'端腺苷酰化修饰的试剂盒。
本试剂盒制备产生的5'端腺苷酰化修饰的单链DNA,常用于miRNA等3'端为羟基的RNA或3'端为羟基的单链DNA在克隆、高通量测序建库或PCR检测等时,在3'端添加的接头。
本试剂盒进行腺苷酰化修饰反应时,需要腺苷酰化酶(Adenylase)、ATP和待腺苷酰化修饰的5’端磷酸化的单链DNA。
本试剂盒腺苷酰化修饰效率高,通常可以达到95%以上。对5'端磷酸化的单链DNA进行腺苷酰化修饰反应时,无论该单链DNA的3'端是否进行了氨基化等封闭都可以得到高产量的腺苷酰化产物。通常本试剂盒能将95%以上的5'端磷酸化的DNA (pDNA)转化成腺苷酰化DNA (AppDNA),因此腺苷酰化的产物通常不需要进行电泳切胶回收,可以直接通常乙醇沉淀进行进一步浓缩后用于后续的连接反应。
本产品以5'端磷酸化的单链DNA为底物,腺苷酰化酶将ATP分解成AMP和PPi,AMP转移到单链DNA的5'磷酸基团上,形成腺苷酰化单链DNA,从而制备出腺苷酰化接头(linker)。
本试剂盒催化5'端磷酸化单链DNA生成5'端腺苷酰化修饰单链DNA的效果参见图1。
图1. 使用碧云天生产的5'DNA Adenylation Kit制备5'端腺苷酰化修饰单链DNA的效果图。反应体系为20μl,单链DNA的终浓度为5μM,反应条件为65ºC分别孵育15、30、45、60和90min,反应完毕后85℃孵育5min终止反应。电泳上样前95℃孵育5min随后置于冰浴以充分变性,尿素(7M)变性聚丙烯酰胺凝胶(15%)进行凝胶电泳分析。如图所示,本试剂盒在15min内就可以将大部分5'端磷酸化单链DNA (pDNA)催化生成腺苷酰化的单链DNA (AppDNA),孵育60min可以确保将95%以上的底物转化成腺苷酰化修饰的单链DNA。
本产品也可以用于5'端磷酸化的单链RNA的5'端腺苷酰化修饰,可根据具体应用选择合适的实验步骤,同时需要额外准备R0102 RNase Inhibitor和R0021 DEPC水等。
本产品包含的Adenylase来源为嗜热古细菌,在大肠杆菌中进行表达而获得。
优点:单步反应即可完成5'端磷酸化修饰的单链DNA或RNA的腺苷酰化修饰,与传统的化学方法相比较,更加简便;对于底物转化效率高达95%以上,无需切胶纯化仅需酒精沉淀等即可用于后续反应;在65℃这样一个较高的温度反应,可以有效避免二级结构对于5'端腺苷酰化修饰反应的干扰;适用于pmol级别底物量的反应体系,也可以很方便地放大至µmol级别底物量的反应体系。
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R0716S-1 | Adenylase | 20µl |
R0716S-2 | 10X Adenylation Reaction Buffer | 25µl |
R0716S-3 | ATP (1mM) | 25µl |
— | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R0716M-1 | Adenylase | 100µl |
R0716M-2 | 10X Adenylation Reaction Buffer | 125µl |
R0716M-3 | ATP (1mM) | 125µl |
— | 说明书 | 1份 |
-20℃保存,至少一年有效。
注意事项:底物单链DNA或单链RNA的5'端磷酸化是必须的,3'端可以进行氨基化等封闭,也可以不封闭。
本试剂盒提供的腺苷酰化反应体系可以按比例放大反应体系,对腺苷酰化产物的得率无显著影响。
本试剂盒提供的Adenylase的最佳反应温度为65℃,并且在25℃时会出现去腺苷酰化现象,因此反应完成后推荐在85℃孵育5min以失活Adenylase。如果没有失活Adenylase,后续经历室温温度条件时,会导致腺苷酰化比率下降。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
Reagent | Volume | Final Concentration |
Water (DNase free or DEPC-treated) | 13µl | - |
ssDNA or ssRNA (100µM) | 1µl | 5µM |
10X Adenylation Reaction Buffer | 2µl | 1X |
ATP (1mM) | 2µl | 0.1mM |
Adenylase | 2µl | - |
Total Volume | 20µl | - |