碧云天研发生产的Recombinant Human FTO Protein (EC 1.14.11.53),也称Fat Mass and Obesity-associated Protein (FTO),中文名为脂肪量和肥胖相关蛋白,是由碧云天自主研发的PerfectProtein™技术平台表达、纯化获得的一种RNA去甲基酶。FTO属于α-酮戊二酸(α-Ketoglutarate, α-KG)和Fe(II)依赖的双加氧酶(Dioxygenase)家族,可以有效去除单链RNA的m6A甲基化修饰[1, 2],还可以催化ssRNA中3-甲基尿嘧啶(m3U)和ssDNA中3-甲基胸腺嘧啶(m3T)的氧化去甲基化[3]。FTO对单链核酸具有偏好性,更倾向于ssDNA/RNA作为底物,首选底物是甲基化的RNA [4]。
FTO对ssDNA/RNA的m6A去甲基化的反应原理如下。FTO在体外以α-酮戊二酸和Fe(II)依赖的方式催化m6A去甲基化时,先将α-酮戊二酸转化为琥珀酸(Succinate)和CO2,生成不稳定的羟甲基,羟甲基再分裂成甲醛和去甲基化碱,并进一步转化为腺苷(Adenosine) [5]。
图1.FTO催化ssDNA/RNA的m6A去甲基化的反应图。
FTO基因仅存在于脊椎动物和海藻中,在脊椎动物的下丘脑、垂体和肾上腺中高表达[3, 6],FTO蛋白定位于细胞核中[7]。FTO与一系列代谢和神经退行性疾病包括肥胖、糖尿病、非酒精性脂肪性肝炎和阿尔茨海默症等密切相关[8];FTO内的单核苷酸多态性(Single-nucleotide polymorphisms, SNPs)与肥胖以及子宫内膜癌、乳腺癌、胰腺癌和黑色素瘤等癌症有关。此外,FTO还有具有调节脂肪生成的作用;多种癌症疾病包括急性髓性白血病、胶质母细胞瘤、宫颈鳞状细胞癌和黑色素瘤等都与FTO和m6A修饰失调相关[9],因此FTO成为许多癌症精准医学的潜在靶点。
碧云天Recombinant Human FTO Protein去除ssDNA的m6A甲基化修饰的效果参考图2。
图2.碧云天Recombinant Human FTO Protein (R0649)对ssDNA的m6A修饰的去甲基化效果图。在20µl反应体系中,加入3µM的ssDNA和0/0.63/1.25/2.5µM FTO,25ºC孵育2小时。孵育结束后,取2.2µl (100ng ssDNA)反应产物滴至尼龙膜上,待样品风干后,进行紫外交联,然后用Wash Buffer洗涤3分钟,再用Blocking Buffer室温封闭2-3小时,之后将膜转移至N6-Methyladenosine (m6A) Rabbit Polyclonal Antibody (AF7407)中,4ºC孵育过夜。次日,用Wash Buffer室温洗涤4次,每次5分钟;随后将尼龙膜浸泡在适当稀释的辣根过氧化物酶标记山羊抗兔IgG(H+L) (A0208)溶液中,室温孵育1小时。然后用Wash Buffer室温洗涤4次,每次5分钟;最后用BeyoECL Star (特超敏ECL化学发光试剂盒) (P0018A)进行化学发光,并使用BeyoImager™ 600化学发光成像系统记录化学发光效果。实验结果如图2所示,3µM的ssDNA用2.5µM FTO处理2小时,可以基本去除其中的m6A甲基化。实际检测效果会因实验条件、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。
用途:适用于FTO酶动力学、抑制剂筛选和选择性分析。
来源:大肠杆菌表达的人源FTO基因。
纯度:不含DNA内切酶和外切酶,不含RNA酶,不含磷酸酯酶。
酶储存溶液:150mM NaCl, 50% (v/v) Glycerol, 50mM HEPES (pH8.0 @ 25ºC).
失活或抑制:加入5mM EDTA,随后95ºC处理5分钟。
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R0649S-1 | Recombinant Human FTO Protein (1mg/ml) | 50µl |
R0649S-2 | Reaction Buffer I (10X) | 250µl |
R0649S-3 | Reaction Buffer II (10X) | 250µl |
— | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R0649M-1 | Recombinant Human FTO Protein (1mg/ml) | 200µl |
R0649M-2 | Reaction Buffer I (10X) | 1ml |
R0649M-3 | Reaction Buffer II (10X) | 1ml |
— | 说明书 | 1份 |
-20ºC保存,至少一年有效。
注意事项:本产品使用时宜放在冰盒内或冰浴上,使用完毕后宜立即放置于-20ºC保存。
由于涉及RNA和DNA操作,须严格按照RNA和DNA操作的规范进行,避免RNase和DNase污染。
实验中用到的吸头、离心管等实验耗材必须为RNase和DNase free的或须经DEPC处理,推荐选购碧云天的BeyoGold™系列中无RNase和DNase污染的耗材产品。不含RNase和DNase的超纯水推荐使用碧云天的BeyoPure™ Ultrapure Water (DNase/RNase-Free, Sterile) (ST876)或DEPC水(DNase、RNase free) (R0021/R0022)。
桌面等环境以及仪器设备表面的RNase、DNase、RNA和DNA的去除推荐使用碧云天的RNase, DNase, RNA and DNA Away (R0127)进行快速处理。
可根据具体应用选择合适的操作方法,可能需准备额外的试剂,如RNase Inhibitor、超纯水等。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
Reagent | Volume | Final Concentration |
Nuclease-Free Water | (15.4-x)µl | - |
Reaction Buffer I (10X) | 2µl | 1X |
Reaction Buffer II (10X) | 2µl | 1X |
ssDNA/RNA (100µM) | 0.6µl (60pmol) | 3µM |
Recombinant Human FTO Protein (1mg/ml) | xµl | ≥0.136mg/ml (2.5µM) |
Total Volume | 20µl | - |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
A0208 | 辣根过氧化物酶标记山羊抗兔IgG(H+L) | 1ml |
AF6936 | FTO Rabbit Polyclonal Antibody | 50µl |
AF7407 | N6-Methyladenosine (m6A) Rabbit Polyclonal Antibody | 50µl |
FFN10 | 尼龙膜(带正电荷, 进口分装, 7.5×8.25cm, 0.45μm) | 20张/包装 |
FFN11 | 尼龙膜(带正电荷, 进口分装, 7.5×8.25cm, 0.45μm) | 100张/包装 |
FFN13 | 尼龙膜(带正电荷, 进口分装, 15×16.5cm, 0.45μm) | 5张/包装 |
FFN15 | 尼龙膜(带正电荷, 进口原装, 30cm×3.3m/卷, 0.45μm) | 1卷/包装 |
L02605 | FTO基因敲除质粒 | 5µg |
L02606 | FTO基因敲除慢病毒 | 108 TU |
L02607 | FTO基因敲除HEK293T细胞 | 1支/瓶 |
L02608 | FTO基因敲除HEK293T细胞RIPA裂解液 | 100µg |
L02609 | FTO基因敲除HEK293T细胞Trizol裂解液 | 500µl |
P0459 | BeyoGel™ Plus PAGE预制胶(Tris-Gly, 12%, 15孔) | 10/50块 |
QH09073S | Human FTO qPCR Primer Pair | 200次 |
QM06090S | Mouse Fto qPCR Primer Pair | 200次 |
R0021 | DEPC水(DNase、RNase free) | 100ml |
R0022 | DEPC水(DNase、RNase free) | 500ml |
R0101 | RNase Inhibitor, Murine | 2/10/50/200kU |
R0102 | RNase Inhibitor | 2000/10000/50000U |
R0105 | RNase Inhibitor Plus, Human Placenta | 2/10/50/200kU |
R0106 | RNase Inhibitor, Human Placenta | 2/10/50/200kU |
R0125 | RNase, DNase and DNA Away | 250ml |
R0127 | RNase, DNase, RNA and DNA Away | 250ml |
R0639 | AlkB (RNA/DNA去甲基化酶, Nuclease-free) | 200/1000/5000U |
R0641 | AlkB (D135S) (RNA m1G去甲基化酶, Nuclease-free) | 50/250/1250U |
R0643 | AlkB (D135S/L118V) (RNA m22G去甲基化酶, Nuclease-free) | 50/250/1250U |
R0649 | Recombinant Human FTO Protein | 50/200µg |
ST476 | PBS (10X) | 500ml |
ST876 | BeyoPure™ Ultrapure Water (DNase/RNase-Free, Sterile) | 100ml/500ml |