碧云天BeyoClick™ EU-488 RNA合成检测试剂盒(BeyoClick™ EU RNA Synthesis Kit with Alexa Fluor 488),是一种基于RNA合成过程中尿嘧啶核苷(Uridine)类似物EU (5-ethynyl-uridine)的掺入,并通过随后的点击反应(Click reaction)使EU被Alexa Fluor 488所标记,从而实现简单、快速、高灵敏地检测新合成RNA的试剂盒。
本试剂盒可以检测到活细胞或组织样品中新合成的RNA,而不检测DNA[1]。检测过程中不需要放射性同位素和抗体,只需要简单的两步反应即可完成。
经本试剂盒处理后,有RNA合成的细胞在荧光显微镜下呈现较强的绿色荧光,可以用于荧光显微镜、激光共聚焦显微镜、流式细胞仪或荧光酶标仪检测,也可以用于高内涵筛选(High-content screening, HCS)。流式细胞仪或荧光酶标仪检测仅适用于细胞样品,不适用于组织切片。
EU (5-ethynyl-uridine),中文名为5-炔基尿苷,是一种新型尿嘧啶核苷(Uridine)类似物,EU可以在RNA合成过程中替代尿苷掺入到新合成的RNA中。另一方面,EU上的乙炔基能与荧光标记的小分子叠氮化物探针(如Azide Alexa Fluor 488、Azide Alexa Fluor 555、Azide Alexa Fluor 594、Azide Alexa Fluor 647等)通过一价铜离子的催化发生共价反应,形成稳定的三唑环,该反应非常迅速高效,被称作点击反应(Click reaction),其反应原理参见图1。通过点击反应,新合成的RNA会被相应的荧光探针所标记,从而可以使用适当的荧光检测设备检测到新合成RNA。
图1. 碧云天BeyoClick™系列RNA合成检测试剂盒中的点击反应(Click reaction)原理图。荧光探针等标记的叠氮化物(Labeled Azide)与掺入到细胞RNA中的EU,在铜离子的催化发生共价反应,形成稳定的三唑环,最终使细胞RNA标记上荧光探针或其它探针。
本试剂盒反应简单、检测灵敏度高。本试剂盒基于简单高效的点击反应,无需特殊温度,只需少量的小分子叠氮化物探针即可非常有效地标记掺入的EU,并且可以检测到单个细胞的RNA合成情况。
本试剂盒使用便捷、兼容性好。本试剂盒只需常用的多聚甲醛固定和Triton X-100穿透,就可以使叠氮化物探针有效进入细胞并发生点击反应,不会影响细胞形态,不会产生多余的附加产物,不会影响基于抗体的免疫荧光和免疫组化检测,也不会影响DNA的荧光染色(如PI染色检测细胞周期、DAPI或Hoechst染料检测细胞核等)。
本试剂盒检测快速。本试剂盒采用的BeyoClick™ EU法检测新合成的RNA仅需1.5-2小时。本试剂盒操作流程请参考图2。
本试剂盒同时提供了染色细胞核的Hoechst 33342,以方便染色观察所有的细胞核。HeLa细胞用本试剂盒检测新合成RNA的效果参见图3。
图3. 碧云天BeyoClick™ EU-488 RNA合成检测试剂盒(R0301)检测HeLa细胞新合成RNA的效果图。EU孵育2小时后检测,无EU组观察不到绿色荧光(最左侧一列);EU (1mM)组有较强的绿色荧光(中间一列);而用RNA合成抑制剂Actinomycin D (1μM)提前预处理0.5小时后,绿色荧光显著减弱,说明RNA合成抑制后,EU的掺入被显著抑制(最右侧一列)。实际检测效果会因实验条件、检测仪器等的不同而存在差异,图中效果仅供参考。
本试剂盒小包装R0301S如果用于培养的细胞(6孔板)的检测,可以检测50个样品, 每个样品的反应体系为500μl的Click反应液;如果用于96孔板检测,可以检测500个样品,每个样品的检测体系为50μl的Click反应液;如果用于12孔、24孔、48孔或384孔板样品的检测,分别可以检测125、250、350和1250个样品,每个样品推荐的Click反应液用量为200μl、100μl、70μl和20μl;如果用于流式细胞仪检测,可以检测50个样品,每个细胞样品的细胞数量宜为10-100万,每个样品的反应体系为500μl的Click反应液;如果用于冰冻或石蜡切片的检测,可以检测125-250个样品, 每个样品的反应体系为100-200μl的Click反应液。大包装R0301L可检测样品的数量为小包装R0301S的4倍。
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R0301S-1 | EU (100mM) | 1.1ml |
R0301S-2 | Azide 488 | 55μl |
R0301S-3 | Click Reaction Buffer | 30ml |
R0301S-4 | CuSO4 | 1.1ml |
R0301S-5 | Click Additive | 2管 |
R0301S-6 | Hoechst 33342 (1000X) | 50μl |
— | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R0301L-1 | EU (100mM) | 4.4ml |
R0301L-2 | Azide 488 | 220μl |
R0301L-3 | Click Reaction Buffer | 120ml |
R0301L-4 | CuSO4 | 4.4ml |
R0301L-5 | Click Additive | 1瓶 |
R0301L-6 | Hoechst 33342 (1000X) | 200μl |
— | 说明书 | 1份 |
-20ºC保存,一年有效。Azide 488和Hoechst 33342须避光保存。
Click Additive配制成溶液后请注意适当分装冻存。如果溶解后有白色物质析出,请上下颠倒多次,待全部溶解后使用。如果该溶液颜色变成棕色,说明该组分的有效成分已失效,请弃用。
如果用于动物实验需要更多EU,可以从碧云天订购5-Ethynyl Uridine (EU) (≥98%, BioReagent) (ST2055)。
由于本产品需要铜离子催化进行点击反应,请注意如下的兼容性问题及解决方案。本产品完全兼容有机类染料如Alexa Fluor®系列普通染料及Fluorescein (FITC)、Allophycocyanin (APC)及APCE-tandems染料;对于Qdot®纳米晶体探针、Horseradish peroxidase (HRP)、R-phycoerythrin (R-PE)和R-PE-tandems染料如Alexa Fluor® 680-R-PE等,需要在点击反应完成后进行反应和检测;本产品会影响GFP、RFP、mCherry等荧光蛋白的荧光,对于荧光类蛋白如Green Fluorescent Protein (GFP)、TC-FlAsH™和TC-ReAsH™类试剂,需要在点击反应前进行反应和检测。由于Phalloidin (鬼笔环肽)不兼容点击反应,推荐使用Tubulin-Tracker Red (C1050)进行细胞微管的检测。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
1. 需要用户自己准备的耗材和试剂
a.PBS (pH7.2-7.6) (C0221A)。
b. 固定液(推荐使用免疫染色固定液(P0098)或4%多聚甲醛固定液(P0099))。
c. 洗涤液(推荐使用免疫染色封闭液(P0102),QuickBlock™免疫染色封闭液(P0260),或含3% BSA的PBS)。
d. 通透液(推荐使用免疫染色强力通透液(P0097),免疫染色洗涤液(P0106),或含0.3% Triton X-100的PBS)。
e. 去离子水或超纯水。
f. 根据实验要求:18×18mm盖玻片(FCGF18),6孔板或其它多孔板,或流式细胞分析仪用管子(如12×75mm)。
2. 检测体系的准备
a. 如下以6孔板或常规切片检测体系为例,如果使用12孔板、96孔板或384孔板等孔板,检测体系可以相应按比例缩小。
b. 如果检测的是悬浮细胞,请按常规的悬浮细胞的操作方式进行。例如和贴壁细胞相比,相关步骤需要增加离心步骤等,如1000×g室温离心5分钟。
3. 培养细胞的EU标记及固定、洗涤和通透
a. 在6孔板中(如有必要可以加入盖玻片)培养适当数量的细胞。细胞培养过夜并且恢复到正常状态后,进行所需的药物处理或者其它刺激处理等。
b. 配制2X的EU工作液:由于EU工作液是与培养液等体积加入到孔板中,所以需要配制成2X的工作液。推荐的EU终浓度为1mM (1X),用细胞培养液50:1稀释EU (100mM)即可得到2X的EU工作液(2mM),例如取100μl EU (100mM)加入4.9ml中,即得5ml 2X的EU工作液(2mM)。
注:对于A549、HeLa和NIH/3T3等贴壁细胞,推荐EU的使用终浓度为1mM。但细胞类型、培养液种类、细胞密度、细胞增殖速度等多方面的因素会影响EU掺入到细胞中的量,因此初次使用时建议对EU的使用浓度进行一定的摸索。如果之前使用过BrU进行实验,则可以参考BrU的终浓度作为EU的终浓度。
c. 将37ºC预热的2X的EU工作液(2mM),等体积加入6孔板中,使6孔板中的EU终浓度变为1X。例如设计终浓度为1mM,原先6孔板中的培养液为1ml,则将1ml 2X的EU工作液(2mM)加入到孔板中。如果培养液体积过大,可以先吸除适量的培养液,再加入等体积的2X的EU工作液;或者可以减少EU工作液的体积并增加EU的浓度,使最终培养液中的EU浓度为1mM,例如2ml培养液中加入220μl 10mM EU。如果加药处理的,建议保持原来的药物浓度,直接添加适量EU在原培养孔中。
d. 继续孵育细胞2小时。该孵育时间的长短取决于细胞生长速率,通常宜继续孵育细胞周期10%左右的时间。对于常见的哺乳动物细胞如HeLa、3T3、HEK293等,细胞周期大约在18-25小时,孵育时间宜在2小时左右。人胚胎细胞的细胞周期约30分钟,推荐的孵育时间为5分钟;酵母细胞的细胞周期约3小时,推荐的孵育时间为20分钟,增殖的神经细胞其细胞周期约5天,推荐的孵育时间为1天。孵育时间小于45分钟时,建议提高EU的浓度;孵育时间大于20小时时,建议适当降低EU的浓度。
e. EU标记细胞完成后,去除培养液,并加入1ml固定液,室温固定15分钟。注:对于流式细胞仪检测,贴壁细胞胰酶消化后用培养液重悬后再固定。
f.去除固定液,每孔用1ml洗涤液洗涤细胞3次,每次3-5分钟。
g. 去除洗涤液,每孔用1ml通透液,室温孵育10-15分钟。
h. 去除通透液,每孔用1ml洗涤液洗涤细胞1-2次,每次3-5分钟。
i. 转步骤5。
4. 动物体内EU的标记及切片样品的处理
EU可以通过注射或进食等适当方式进行动物的体内标记。如下以小鼠为例,其它动物体内EU的标记请参考相关文献。
a.对于小鼠,可以按照100-400mg/kg的用量,把EU用PBS配制成一定浓度,腹腔注射、特定组织或器官局部注射或者加入饮用水中。具体用量与所用动物的种类、体重以及使用方式有关,可以参考相关文献,因此初次使用时建议对EU的使用浓度进行一定的摸索,或者直接使用200mg/kg的浓度进行测试。如果之前使用过BrU进行实验,则可以参考BrU的终浓度作为EU的终浓度。EU可以单独购买碧云天的ST2055。
b. 4小时后或根据特定实验确定的适当时间后,快速处死小鼠,取出所需的组织,按照常规步骤制作冰冻切片或石蜡切片。EU标记的时间也可以参考相关文献自行调整。
c. 对于冰冻切片:
(a) 加入适量固定液,室温固定15分钟。
(b) 去除固定液,用适量洗涤液洗涤3次,每次3-5分钟。
(c) 去除洗涤液,用适量通透液,室温孵育10-15分钟。
(d) 去除通透液,用适量洗涤液洗涤1-2次,每次3-5分钟。
(e) 抗原修复(选做):如果同时需要进行目的蛋白的免疫荧光染色,并有必要进行抗原修复,可以使用适当的抗原修复液,例如P0090 冰冻切片快速抗原修复液(5X),或者自行配制的适当的抗原修复液进行抗原修复处理。
(f) 转步骤5。
d. 对于石蜡切片:
(a) 脱蜡:二甲苯中脱蜡5-10分钟。换用新鲜的二甲苯,再脱蜡5-10分钟。无水乙醇5分钟,换新的无水乙醇3分钟。95%乙醇3分钟。85%乙醇3分钟。75%乙醇3分钟。50%乙醇3分钟。PBS 5分钟。
(b) 抗原修复(选做):如果同时需要进行目的蛋白的免疫组化染色,可以使用适当的抗原修复液,例如P0081 柠檬酸钠抗原修复液(50X)、P0083 改进型柠檬酸钠抗原修复液(50X)、P0085 EDTA抗原修复液(50X)、P0086 柠檬酸钠-EDTA抗原修复液(40X)、P0088 通用型强力抗原修复液(10X)、P0092 漂片抗原修复液(10X),或者自行配制适当的抗原修复液进行抗原修复处理。
特别注意:如果使用蛋白酶K或胰酶进行抗原修复,必须反复洗涤干净,否则残留的酶会严重干扰后续标记反应。
(c) 转步骤5。
5. EU检测
注:本步骤6孔板中每孔的反应体系为500μl的反应混合物。对于12、24、48、96和384孔板,每孔的反应的体系分别为200μl、100μl、70μl、50μl和20μl的反应混合物。对于较小的孔,单位培养面积的液体用量已经适当增加,以有效避免液体蒸发可能带来的负面影响。对于切片,可以根据切片大小,每个切片使用100-200μl的反应混合物。如下以6孔板中的细胞样品为例说明具体的操作方法,对于其它孔板或切片,仅每步溶液的用量按比例调整即可,其余方法相同。
a. 配制Click Additive Solution:对于R0301S,用1.3ml去离子水溶解试剂盒中提供的一管Click Additive,混匀至全部溶解,即为Click Additive Solution;对于R0301L,加入10.4ml去离子水溶解试剂盒中提供的一瓶Click Additive,混匀至全部溶解,即为Click
Additive Solution。配制后可以适当分装,并-20ºC保存。
b. 参考下表配制Click反应液。注:请严格按照下表中组分顺序和体积配制Click反应液,否则点击反应可能无法有效进行;Click反应液须在配制后15分钟内使用。
Components |
Wells of 6 well plates |
||||||
1 | 2 | 4 | 5 | 10 | 25 | 50 | |
Click Reaction Buffer |
430μl |
860μl |
1.72ml |
2.15ml |
4.3ml |
10.75ml |
21.5ml |
CuSO4 |
20μl |
40μl |
80μl |
100μl |
200μl |
500μl |
1ml |
Azide 488 |
1μl |
2μl |
4μl |
5μl |
10μl |
25μl |
50μl |
Click Additive Solution |
50μl |
100μl |
200μl |
250μl |
500μl |
1.25ml |
2.5ml |
Total volume |
500μl |
1ml |
2ml |
2.5ml |
5ml |
12.5ml |
25ml |
c. 去除上一步骤中的洗涤液。
d. 每孔加入0.5ml Click反应液,轻轻摇晃培养板以确保反应混合物可以均匀覆盖样品。
e. 室温避光孵育30分钟。
f. 吸除Click反应液,用洗涤液洗涤3次,每次3-5分钟。
g. 如果需要对细胞核进行染色,可以参照步骤6进行。如无其它的特殊需要,即可在荧光显微镜下观察,或者使用流式细胞仪、多功能酶标仪进行荧光检测,或者用高内涵筛选仪器(一般高内涵筛选需要使用染料对细胞核进行染色)进行检测。Azide 488的最大激发波长是495nm,最大发射波长是519nm。
6. 细胞核染色
为了检测细胞增殖的比例,可以考虑使用Hoechst 33342进行细胞核染色。一般高内涵筛选仪器也需要对细胞核进行染色。
a. 1X Hoechst 33342溶液的配制:按1:1000比例用PBS稀释Hoechst 33342 (1000X),例如取1μl Hoechst 33342 (1000X)加入1ml PBS中,混匀,即得1ml 1X Hoechst 33342溶液。
b.接步骤5g,吸除洗涤液后,每孔加1X Hoechst 33342溶液1ml,室温避光孵育10分钟。
c. 吸除1X Hoechst 33342溶液。
d. 用洗涤液洗涤3次,每次3-5分钟。
e. 随后即可进行荧光检测。Hoechst 33342为蓝色荧光,最大激发波长为346nm,最大发射波长为460nm。
7. 流式细胞仪检测
对于经步骤5或6获得的细胞悬液样品进行流式检测。如果使用传统的流体动力学聚焦的流式细胞仪来测量总RNA含量,请在检测过程中使用低流速,实验中的每个样品应使用相同的收集速率和细胞浓度。EU标记产生的荧光信号一般使用对数刻度的横坐标。Azide 488的最大激发波长是495nm,最大发射波长是519nm。
注1:建议使用未经EU标记的细胞样品作为流式细胞仪检测的阴性对照,并选择合适的电压。
注2:由于流式细胞仪检测比较灵敏,可根据细胞类型和实际染色情况对Azide 488的使用量进行适当调整。
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
C0071S/L | BeyoClick™ EdU-488细胞增殖检测试剂盒 | 50-500/200-2000次 |
C0075S/L | BeyoClick™ EdU-555细胞增殖检测试剂盒 | 50-500/200-2000次 |
C0078S/L | BeyoClick™ EdU-594细胞增殖检测试剂盒 | 50-500/200-2000次 |
C0081S/L | BeyoClick™ EdU-647细胞增殖检测试剂盒 | 50-500/200-2000次 |
C0085S/L | BeyoClick™ EdU细胞增殖检测试剂盒(DAB法) | 50-500/200-2000次 |
C0088S/L | BeyoClick™ EdU细胞增殖检测试剂盒(TMB法) | 50-500/200-2000次 |
R0301S/L | BeyoClick™ EU-488 RNA合成检测试剂盒 | 50-500/200-2000次 |
R0305S/L | BeyoClick™ EU-555 RNA合成检测试剂盒 | 50-500/200-2000次 |
R0309S/L | BeyoClick™ EU-594 RNA合成检测试剂盒 | 50-500/200-2000次 |
R0311S/L | BeyoClick™ EU-647 RNA合成检测试剂盒 | 50-500/200-2000次 |
P1202S/L | BeyoClick™ HPG-488蛋白合成检测试剂盒 | 50-500/200-2000次 |
P1206S/L | BeyoClick™ HPG-555蛋白合成检测试剂盒 | 50-500/200-2000次 |
P1209S/L | BeyoClick™ HPG-594蛋白合成检测试剂盒 | 50-500/200-2000次 |
P1213S/L | BeyoClick™ HPG-647蛋白合成检测试剂盒 | 50-500/200-2000次 |
P1217S/L | BeyoClick™ HPG蛋白合成检测试剂盒(DAB法) | 50-500/200-2000次 |
P1221S/L | BeyoClick™ HPG蛋白合成检测试剂盒(TMB法) | 50-500/200-2000次 |
P1215S/L | BeyoClick™ HPG蛋白合成检测试剂盒(WB法) | 50/200次 |
ST067-50mg/250mg/1g | EdU | 50mg/250mg/1g |
ST2055-50mg/250mg/1g | 5-Ethynyl Uridine (EU) (≥98%, BioReagent) | 50mg/250mg/1g |
ST2057-5mg/25mg/100mg | L-Homopropargylglycine (HPG) (≥98%, BioReagent) | 5mg/25mg/100mg |