Rapid PNGase F去糖基化试剂盒(非变性法)
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产品编号 P2543L
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¥ 11998.00
产品包装:
25次 100次 500次
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碧云天生产的Rapid PNGase F去糖基化试剂盒(非变性法),即Rapid PNGase F Deglycosylation Kit (Native Method),是一种非变性快速去糖基化试剂盒。与PNGase F去糖基化试剂盒(P2318)去除N-糖基化修饰需要几小时甚至过夜相比,本试剂盒仅需50ºC孵育10分钟即可完成对糖蛋白N-聚糖链的去除,同时保留蛋白内部二硫键和整体三维构象的完整,可有效缩短样品处理时间,处理后的样品可用于SDS-PAGE、Western、高效液相色谱(HPLC)或质谱分析(Mass spectrometry)等。本试剂盒也可以间接用于抗体、免疫球蛋白融合蛋白或其它糖蛋白的糖基化水平检测。

糖基化修饰(Glycosylation)是一种蛋白质翻译后修饰(Post-translational modification, PTM),几乎存在于所有生物体中,包括真核生物、真细菌(Eubacteria)和古细菌(Archaea)。糖基化修饰的多样性会改变蛋白的质量和电荷,在蛋白质分类、免疫识别、受体结合、炎症、致病性和许多其他过程中发挥着关键的生物功能[1-3]。最新的研究表明,核酸也存在糖基化修饰。

抗体药物的生产中调节和控制糖基化修饰对抗体的活性、药代动力学和免疫原性都有着重要影响。例如在IgG的Fc部分Asn297处有一个保守的N-聚糖链,很多抗体还有额外的N-聚糖链,这些N-聚糖链可能对抗体的活性、半衰期和免疫反应至关重要;而且细胞培养过程中的变量,可能进一步增加抗体糖基化修饰的多样性,因此N-聚糖链的表征和质量控制是抗体药物的关键质量属性(Critical quality attributes, CQAs)之一[4]。

Rapid PNGase F与PNGase F功能相同,通过E.coli重组表达,可以在几乎所有类型的N-多糖如高甘露糖(High mannose)、混合型和复杂寡聚糖(Hybrid and complex oligosaccharides)的最内端N-乙酰葡萄糖胺(GlcNAc, N-acetylglucosamine)和天冬酰胺(Asparagine, Asn)残基的连接处切割,从而移除N-寡聚糖(N-linked oligosaccharides),将蛋白和糖链修饰分开(图1) [5]。本试剂盒提供的Rapid PNGase F的N端带有His-tag,反应后通过相应的His抗体琼脂糖凝胶、磁珠或镍柱吸附去除。

图1.碧云天Rapid PNGase F去糖基化试剂盒(非变性法) (P2543)移除N-糖苷(N-linked oligosaccharides)的示意图。糖链可以在图中戊糖(Pentasaccharide)的R1、R2和R3位置延伸。R1位置只能是空缺或α-6 fucose,不能是α-3 fucose,否则就不能被Rapid PNGase F切割。R2和R3位置可以是任意的单糖或多糖。

本试剂盒去除不同种属IgG的N-糖基化修饰效果如图2所示。

图2.Rapid PNGase F去糖基化试剂盒(非变性法) (P2543)去除不同种属IgG的N-糖基化修饰效果图。图中上图为Non-reducing SDS-PAGE,即SDS-PAGE蛋白上样缓冲液中不含DTT、巯基乙醇等还原性试剂,抗体重链(Heavy chain, HC)和轻链(Light chain, LC)之间的二硫键和两条重链铰链区(Hinge region)之间的二硫键都没有被破坏,因此电泳条带在150kDa左右;图中下图为Reducing SDS-PAGE,即SDS-PAGE蛋白上样缓冲液中含有DTT、巯基乙醇等还原性试剂,抗体内部二硫键全部被破坏,重链和轻链分开,因此电泳条带有两条:重链在50kDa左右,轻链在23kDa左右(轻链条带图中未展示)。C (Control)为未处理的对照。RP (Rapid PNGase F)为非变性方法(Native Method)去除糖基化。在20μl反应体系中,10µg不同种属的IgG分别加入1µl Rapid PNGase F (Native),50ºC孵育10分钟。经BeyoGel™ Plus PAGE预制胶(Hepes, 4-15%, 15孔) (P0520)电泳,并经BeyoBlue™考马斯亮蓝超快染色液(P0017F)染色。图中下图还原条件下的电泳可清晰观察到去糖基化后重链(HC)条带的迁移速率明显加快,图中上图的非还原条件下的电泳也有类似效果。实际效果会因样品种类、检测仪器等的不同而存在差异,图中效果仅供参考。

体外酶解去糖基化修饰反应根据对糖蛋白或糖肽的处理方式不同,可分为变性去糖基化修饰反应(Denaturing deglycosylation)和非变性去糖基化修饰反应(Native deglycosylation)。变性去糖基化修饰反应:蛋白质变性导致三级结构被破坏,内部序列暴露可以去除所有糖基化修饰;非变性去糖基化修饰反应:蛋白原始构象被保留,三级结构中暴露在外的糖苷被移除,但是处于内部的糖苷被保留,蛋白的酶活性或抗原性很可能不受影响。用户可根据实验目的选择碧云天Rapid PNGase F去糖基化试剂盒(变性法) (P2541)和Rapid PNGase F去糖基化试剂盒(非变性法) (P2543)。

Rapid PNGase F (Native)储存液:20mM Tris (pH7.4), 50mM NaCl, 5mM EDTA。

本试剂盒用于移除糖蛋白或糖肽的N-糖苷酶切反应时,如果按照每次使用1μl Rapid PNGase F (Native)在50ºC反应10分钟,本产品小、中、大包装分别可以用于25、100和500次反应。

包装清单:
产品编号 产品名称 包装
P2543S-1 Rapid PNGase F (Native) 25μl
P2543S-2 Native Reaction Buffer (5X) 100μl
说明书 1份

产品编号 产品名称 包装
P2543M-1 Rapid PNGase F (Native) 100μl
P2543M-2 Native Reaction Buffer (5X) 400μl
说明书 1份

产品编号 产品名称 包装
P2543L-1 Rapid PNGase F (Native) 500μl
P2543L-2 Native Reaction Buffer (5X) 2ml
说明书 1份
保存条件:

-20ºC保存,一年有效。

注意事项:

Rapid PNGase F (Native)不能水解含有core α1-3 Fucose的N-糖苷(常见于植物及昆虫糖蛋白,此时需要使用PNGase A)。

避免使用含有SDS的缓冲液,SDS会抑制Rapid PNGase F的酶活性。

Tween、Triton X-100、NP-40、辛基葡萄糖苷(Octyl glucoside)、非去垢剂磺基甜菜碱(Non-detergent sulfobetaine),以及有机溶剂都会抑制Rapid PNGase F (Native)的酶活性。

超纯水推荐选购BeyoPure™ Ultrapure Water (DNase/RNase-Free, Sterile) (ST876)。

本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。

为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

使用说明:
不同糖蛋白的最佳反应用量、孵育时间,可根据聚糖种类、下游分析要求进行调整。通常情况下,1μl Rapid PNGase F (Native)可完成10μg抗体N-聚糖链的去除。反应体系可以根据需要进行放大。
1.按下表在离心管中配制反应体系,并充分混匀。
Reagent Volume
Protein (10μg) x μl
Native Reaction Buffer (5X) 4μl
Ultrapure Water To 19μl
2.75ºC孵育5分钟。
3.冷却至室温后加1μl Rapid PNGase F (Native),并充分混匀。
4.50ºC孵育10分钟。
5.后续即可进行SDS-PAGE、Western等常规分析。如果后续采用质谱分析去糖基化蛋白,推荐使用碧云天的BeyoDesalt™脱盐柱对溶液进行置换。
参考文献:
1.Drickamer K, Taylor ME. Introduction to Glycobiology. Oxford University Press, USA. 2006. ISBN: 978-0-19-928278-4.
2.Lechner J, Wieland F. Annu Rev Biochem. 1989. 58:173-94.
3.Messner P. Glycoconj J. 1997. 14(1):3-11.
4.Liu L. J Pharm Sci. 2015. 104(6):1866-1884.
5.Elder JH, Alexander S. Proc Natl Acad Sci U S A. 1982. 79(15):4540-4.
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