人端粒长度染料法qPCR检测试剂盒
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产品编号 D8025M
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¥ 2088.00
产品包装:
50次 200次
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碧云天研发生产的人端粒长度染料法qPCR检测试剂盒,即Human Telomere Length SYBR Green qPCR Kit,也称人端粒长度染料法qPCR试剂盒、端粒相对长度检测试剂盒、Human Telomere Length qPCR Kit with SYBR Green,是一种通过染料法qPCR (Quantitative PCR)扩增端粒与内参基因DNA,并快速、高效、灵敏地定量不同人类样品的端粒相对长度的试剂盒。本产品为防污染型,含有优化比例的高品质UDG酶和dUTP,可有效消除PCR扩增过程中带来的产物污染问题造成的假阳性或CT值偏低。

端粒(Telomere, Tel)是真核生物染色体末端的由短串联DNA重复序列(TTAGGG)及其相关蛋白组成的保护性复合物。随着细胞分裂的进行,端粒的长度也会随之缩短。端粒极短的细胞就会进入衰老状态,这是一种不可逆的细胞生长停滞状态。因此,端粒的长度可作为判断细胞是否进入衰老状态的重要标志[1]。端粒可以作为受环境暴露和生活经历累积影响的生物标志物,也是重大疾病的风险因素[2]。越来越多的证据表明,端粒缩短对健康状况有负面影响,并与包括衰老和癌症在内的许多健康问题有关。因此,端粒长度的量化在细胞生物学研究的许多方面具有重要意义,包括染色体不稳定性、DNA修复、衰老、细胞凋亡、细胞功能障碍和致癌等[3]。

本试剂盒提供了qPCR实验所需的预混液BeyoFast™ SYBR Green qPCR Mix (2X, UDG)和特异性引物,预混液包含了BeyoFast™ Taq DNA Polymerase、UDG酶、PCR Buffer、dNTPs、dUTP、SYBR Green I荧光染料、稳定剂和镁离子等所有的通用组分。本试剂盒设计了两对引物,一对是基于端粒重复序列设计的端粒引物(Telomere Primer Mix);一对是基于12号染色体上编码酸性核糖体磷酸蛋白(Acidic ribosomal phosphoprotein, PO)的单拷贝基因(Single copy reference, SCR)而设计的内参引物(Control Primer Mix),用于数据的均一化定量。

本试剂盒检测灵敏,扩增效率高,所用引物组检测1.25-20ng/μl范围内的基因组DNA样品时,扩增效率可达95%。不同浓度梯度的HeLa细胞基因组DNA分别使用Telomere Primer Mix和Control Primer Mix扩增,并绘制标准曲线。结果显示两个标曲均呈现良好的线性关系,表明本试剂盒具有稳定的扩增效果,端粒相对长度定量准确度高。使用Telomere Primer Mix的扩增曲线及标准曲线可参考图1,使用Control Primer Mix的扩增曲线及标准曲线可参考图2。

图1.碧云天人端粒长度染料法qPCR检测试剂盒(D8025)中Telomere Primer Mix对于不同浓度梯度的HeLa细胞基因组DNA的扩增曲线及标准曲线。NTC, No Template Control。实测数据可能会因样品、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。注:由于端粒序列的串联重复特性,端粒引物组可能在NTC中形成微量的引物二聚体。NTC组Ct值为28或更大就表示反应中有引物二聚体的形成,可以作为阴性结果处理。

图2.碧云天人端粒长度染料法qPCR检测试剂盒(D8025)中Control Primer Mix对于不同浓度梯度的HeLa细胞基因组DNA的扩增曲线及标准曲线。NTC, No Template Control。实测数据可能会因样品、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。

本试剂盒提供了Low ROX和High ROX,广泛兼容于无需ROX和需要Low ROX或High ROX作为校正染料的荧光定量PCR仪。ROX的作用是用于校正与PCR无关的荧光波动,从而最大限度减少孔间差异。这种差异可能由多种因素引起,如移液误差及样品蒸发等。不同的荧光定量PCR仪对ROX的要求不同,请根据实际所用仪器在配制反应体系时选择添加高浓度ROX (High ROX)、低浓度ROX (Low ROX)或不加ROX。常用仪器所需ROX类型请参考如下表格。

添加ROX类型 适用PCR仪
不需添加 Bio-Rad: CFX384, CFX96, MiniOpticon, iCycler IQ, MyiQ and iQ5;
Eppendorf: Mastercycler ep realplex and realplex2 s;
Qiagen/Corbett Rotor-Gene: 6000;
Roche LightCycler 480; Cepheid SmartCycler; Illumina Eco qPCR
Low ROX ABI: 7500 (Fast), ViiA 7, QuantStudio 6 and 7 Flex Systems;
Stratagene: Mx3000P, Mx3005P and Mx4000;
Qiagen/Corbett Rotor-Gene: 3000;
Bio-Rad/MJ: Chromo4, Opticon 2 and Opticon
High ROX ABI GeneAmp 5700; ABI PRISM 7000, 7700; ABI 7300, 7900HT (Fast); ABI StepOne (Plus)

本试剂盒如果用于常规的96孔板qPCR检测(建议反应体系为20µl)或384孔板qPCR检测(建议反应体系为10µl),本产品小包装分别可以进行50次和100次检测,中包装分别可进行200次和400次检测。

包装清单:
产品编号 产品名称 包装
D8025S-1 BeyoFast™ SYBR Green qPCR Mix (2X, UDG) 500μl
D8025S-2 Telomere Primer Mix (20X) 50μl
D8025S-3 Control Primer Mix (20X) 50μl
D8025S-4 Ultrapure Water 400μl
D8025S-5 Low ROX (50X) 20μl
D8025S-6 High ROX (50X) 20μl
- 说明书 1份

产品编号 产品名称 包装
D8025M-1 BeyoFast™ SYBR Green qPCR Mix (2X, UDG) 2ml
D8025M-2 Telomere Primer Mix (20X) 200μl
D8025M-3 Control Primer Mix (20X) 200μl
D8025M-4 Ultrapure Water 1.5ml
D8025M-5 Low ROX (50X) 80μl
D8025M-6 High ROX (50X) 80μl
- 说明书 1份
保存条件:

-20ºC保存,一年有效。其中BeyoFast™ SYBR Green qPCR Mix (2X, UDG)、Low ROX (50X)、High ROX (50X)须避光保存,并尽量避免反复冻融。

注意事项:

使用前请务必确保试剂完全融化,充分混匀后使用。混匀过程尽量避免产生气泡。

BeyoFast™ SYBR Green qPCR Mix (2X, UDG)、Low ROX (50X)、High ROX (50X)中含有荧光染料,保存本产品或设置PCR反应体系时应避免强光照射,以尽量避免荧光淬灭问题。

经测试,本产品反复冻融10次对使用效果无显著影响,但仍需尽量避免反复冻融。反复冻融可能使产品性能下降。

qPCR检测是超高灵敏度的检测,请尽量在标准的PCR实验室中进行检测。PCR反应设置区域须尽量避免各种可能的扩增产物的污染。虽然本产品为防污染型,但仍建议勿在PCR反应设置区域撕开PCR封板膜或打开PCR管盖,PCR产物宜密封后按扩增后产物要求处理,以避免超高浓度的PCR产物污染实验环境。

建议使用带滤芯的吸头配制PCR体系,这样可以最大限度的避免污染导致的假阳性。推荐BeyoGold™无菌滤芯盒装吸头(FTIP631/FTIP635/FTIP638)。

本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。

为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

使用说明:
1.需要用户自备的耗材、仪器和试剂:
a.荧光定量PCR仪。
b.DNase-free、RNase-free的吸头、离心管、荧光定量PCR用96孔板或384孔板、PCR板封板膜。
2.样品准备:
选择合适的基因组DNA抽提试剂盒,用于提取细胞或组织的基因组DNA。推荐使用基因组DNA小量抽提试剂盒(通用型,离心柱式) (D0063)或BeyoMag™基因组DNA小量抽提试剂盒(通用型, 磁珠法) (D0088),或推荐使用BeyoMag™磁珠法血液基因组DNA抽提试剂盒用于血液样品基因组DNA的提取。注:经提取后的样品须稀释至1.25-20ng/μl范围内任一浓度,并至少足够用于两个样品的检测。浓度过高或过低都可能会影响检测效果。
3.qPCR反应体系的设置:
a.融解并混匀反应所需的各种溶液,置于冰浴上或冰盒内。
b.参考下表在室温或冰浴上设置qPCR反应体系(以96孔板,每孔反应体系为20µl为例)。下表中的Template为样品、标准品和无模板阴性对照(No Template Control, NTC)。对于每个待测样品,都需要准备2个反应体系,分别用于端粒引物(Telomere Primer Mix)和内参引物(Control Primer Mix)的扩增。可使用Ultrapure Water作为阴性对照(NTC)。建议每次检测都设置NTC。
Reagent Volume
BeyoFast™ SYBR Green qPCR Mix (2X, UDG) 10μl
Telomere Primer Mix (20X) or Control Primer Mix (20X)* 1μl
Template 2μl
Without or Low/High ROX (50X) 0 or 0.4μl
Ultrapure Water To 20μl
*注:对于端粒引物(Telomere Primer Mix)反应体系,仅加入Telomere Primer Mix (20X);对于内参引物(Control Primer Mix)反应体系,仅加入Control Primer Mix (20X)。
c.用移液器轻轻吹打混匀或轻微Vortex混匀,室温离心数秒,使液体积聚于管底。推荐BeyoFuge™掌上离心机(5000rpm)或BeyoFuge™基础型微孔板离心机(垂直式, 2500rpm)进行PCR管或板的短暂离心。
d.将设置好的PCR反应管或PCR反应板置于荧光定量PCR仪上,开始PCR反应。
4.qPCR反应程序:
本试剂盒建议采用如下的qPCR程序,本程序是以QuantStudio™ 6 Flex Systems荧光定量PCR仪为例:
a.UDG酶处理:50ºC 5分钟;
b.预变性:95ºC 10分钟;
c.变性:95ºC 15秒;
d.退火:60ºC 30秒;
e.延伸:72ºC 30秒;
f.重复步骤c-e,总共40个循环;
g.熔解曲线分析(可选):95ºC 15秒, 60ºC 15秒, 95ºC 15秒;
h.最后使用荧光定量PCR仪提供的软件分析检测结果。
5.反应结果的定量判断:
a.无模板阴性对照(NTC):端粒引物检测结果应为CT值≥28,内参引物检测结果应为Undetermined或CT值≥38。
b.根据端粒引物组(Tel)和内参引物对照组(PO)的扩增CT值计算样品的端粒相对长度:
(a)样品1的ΔCT (Sample 1) = CT (Tel, Sample 1) - CT (PO, Sample 1)
(b)样品2的ΔCT (Sample 2) = CT (Tel, Sample 2) - CT (PO, Sample 2)
(c)样品间ΔΔCT = ΔCT (Sample 2) – ΔCT (Sample 1)
(d)样品2相对于样品1的端粒相对长度= 2-ΔΔCT
c.计算示例:
使用碧云天人端粒长度染料法qPCR检测试剂盒(D8025)检测2个HeLa细胞基因组DNA样品的端粒相对长度,对应的扩增CT值及根据步骤b计算所得的ΔCT及样品2相对于样品1的端粒相对长度(2-ΔΔCT)见下表。
结论:样品2的平均端粒长度是样品1的1.04倍。
Sample Tel PO ΔCT ΔΔCT 2-ΔΔCT
1 16.55 20.80 -4.25 - -
2 18.42 22.73 -4.31 -0.06 1.04
参考文献:
1.Jue L, Elissa E, Joshua C, Candyce K, Elizabeth S, et al. J Immunol Methods. 2010. 352(1-2): 71-80.
2.Lin J, Smith DL, Esteves K, Drury S. Psychoneuroendocrinology. 2019. 99: 271-278.
3.Monaghan P, Haussmann MF. Trends Ecol Evol. 2006. 21(1):47-53.
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