碧云天生产的BeyoNGS™ Tn5 Transposase,中文名为BeyoNGS™ Tn5转座酶,是一种来源于E.coli、经过改造具有极高活性的Tn5转座酶突变体,可以高效地将Tn5转座子(Transposon)随机插入到目标序列,对于真核和原核生物的DNA都有极高的转座插入效率。本产品可以特异性识别两端含有嵌合末端序列(Mosaic End sequence, ME)的DNA片段(包括含有ME序列的引物),最终形成Tn5转座体(Tn5 Transposome),该转座体可以随机结合靶DNA并切割插入其携带的DNA片段。Tn5转座酶被广泛用于体外转基因(外源基因整合到宿主细胞)和二代测序(Next Generation Sequencing, NGS)建库等领域。
转座子(Transposon),也称为转座元件(Transposable elements, TEs)、跳跃基因(Jumping genes),是一种可以在基因组中“跳跃”到不同位置的遗传元件(Genetic elements)。尽管转座子经常被称为跳跃基因,转座子还是会相对比较稳定地存在于相应的整合位点,并且大部分转座子最终会变得没有跳跃活性。转座子最早由Barbara McClintock在玉米中发现,并在1983年获得了诺贝尔生理医学奖。后续研究发现转座子系统广泛存在于生物界,并逐渐研究开发成为基因分析的有效工具。
BeyoNGS™ Tn5转座酶是由碧云天自主研发的PerfectProtein™技术平台表达、纯化获得的重组蛋白,与野生型Tn5转座酶相比,其插入效率至少提升1000倍,具有转座随机性好、稳定性高、插入位点易测序等特点。
图1. 碧云天的BeyoNGS™ Tn5 Transposase的工作原理图。
BeyoNGS™ Tn5 Transposase与Tn5 Transposase的工作原理相同。Tn5转座酶的工作原理如图1所示。当转座事件发生时,两个Tn5转座酶分子结合到供体DNA (Donor DNA)的转座子的ME序列,形成两个Tn5转座酶分子与供体DNA的复合物①,随后两个Tn5转座酶分子通过C末端相互作用进行联会并环化(Circularization)转座子,形成一个Tn5转座酶二聚体复合物 (Transposase dimer complex)②,在Mg2+存在的条件下,Tn5转座酶切割供体DNA,并携带供体DNA片段离开供体链形成转座体(Transposome)③,当Tn5转座体识别靶点DNA (Target DNA),也称受体DNA (acceptor DNA),并结合到随机靶序列(Target site)上形成转座体与靶序列的复合物④,在Mg2+存在条件下,会对靶序列进行切割,将其携带的供体DNA片段插入靶序列中,形成转座后的DNA序列(Transposed DNA)⑤,切割形成的9bp粘性末端可以通过DNA聚合酶、连接酶作用进行填补,最终两端形成9bp正向重复序列。基因从供体DNA通过Tn5转座酶“剪切”之后“粘贴”到另一受体DNA,实现了基因片段在基因组中的“跳跃”。
产品用途:本产品可用于二代测序(NGS)文库构建时的片段化和加接头;将测序引物引入克隆DNA或质粒;细菌基因敲除库的建立;新型细菌菌株工程改造;目的基因的插入失活;将T7转录启动子、抗性标记等插入靶DNA等。
酶储存溶液:50mM HEPES (pH7.2), 100mM NaCl, 0.1mM EDTA, 1mM DTT, 0.1% Triton X-100, 50% (v/v) Glycerol。
Reaction Buffer (5X):50mM HEPES (pH7.2), 500mM NaCl, 50mM MgCl2。
Stop Buffer (5X):50mM EDTA (pH8.0)。
用于体外转座子插入反应时,按每次使用1μl BeyoNGS™ Tn5 Transposase (40μM),本产品小包装D7102S可以进行20次反应,中包装D7102M可以进行100次反应。
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D7102S-1 | BeyoNGS™ Tn5 Transposase (40μM) | 20μl |
D7102S-2 | Reaction Buffer (5X) | 200μl |
D7102S-3 | Stop Buffer (5X) | 300μl |
- | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D7102M-1 | BeyoNGS™ Tn5 Transposase (40μM) | 100μl |
D7102M-2 | Reaction Buffer (5X) | 1ml |
D7102M-3 | Stop Buffer (5X) | 1.5ml |
- | 说明书 | 1份 |
-20℃保存,一年有效。
注意事项:BeyoNGS™ Tn5 Transposase (40μM)含50%甘油,在-20℃保存不会冻结。须避免-80℃保存,否则会冻结,反复冻融可能会影响Tn5转座酶的活性。
BeyoNGS™ Tn5 Transposase (40μM)较为粘稠,吸取时注意取样量准确,加样后请注意充分吹打混匀,避免产生气泡。
BeyoNGS™ Tn5 Transposase催化的底物为DNA,不能用于RNA实验。
本产品用于转座子插入时只适用于细菌,真核细胞由于核膜的阻挡导致转座子难以插入。具体的反应条件请根据相关文献自行设计和调整。
用于细菌相关研究时,请勿使用化学感受态细胞,化学转化的成功概率极低。推荐使用电转化效率不低于106cfu/µg的电转感受态细胞。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
图2. Tn5转座子示意图。Tn5转座子其两端为19bp ME序列,ME序列可被BeyoNGS™ Tn5转座酶特异性识别。
b.按照下表制备转座子插入混合物。配制过程中需要注意目标DNA纯度,确保无外源核酸污染。Component | Volume |
Reaction Buffer (5X) | 2μl |
Target DNA* | 0.2μg |
molar equivalent Tn5 Transposon | x μl |
BeyoNGS™ Tn5 Transposase (40μM) | 1μl |
ddH2O | To 10μl |
Component | Volume |
Tn5 Transposon DNA (100μg/ml in TE Buffer) | 2μl |
BeyoNGS™ Tn5 Transposase (40μM) | 4μl |
Glycerol (100%) | 2μl |
Total Reaction Volume | 8μl |
Component | Volume |
Annealing Buffer for DNA Oligos (5X) (D0251) | 10μl |
ME (500μM) | 20μl |
Primer-1 or 2 (500μM) | 20μl |
Total Reaction Volume | 50μl |
Step | Temperature |
1 | 95℃, 2min |
2 | 95℃, 8s, -0.1℃ per cycle |
3 | GOTO step 2, 700 cycles |
4 | 4℃ forever |
Component | Volume |
BeyoNGS™ Tn5 Transposase | 10μl |
Adapter 1 (200μM) | 1μl |
Adapter 2 (200μM) | 1μl |
Component | Volume |
DNA | 50-100ng |
Tn5转座体 | 0.5-2μl |
Reaction Buffer (5X) | 4μl |
ddH2O | To 20μl |
图3. 使用碧云天的BeyoNGS™ Tn5 Transposase制备的Tn5转座体用于DNA随机片段化的效果测试图。在20μl反应体系中,加入100ng Lambda DNA及相应量的Tn5转座体,55℃孵育10分钟,反应完毕入5μl Stop Buffer (5X),混匀后55℃孵育5分钟终止反应,加入5μl DNA上样缓冲液(6X) (D0071),使用 BeyoGel™琼脂糖预制胶(D0161)进行电泳检测。实际效果会因样品种类、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。
相关产品:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D0251 | Annealing Buffer for DNA Oligos (5X) | 1ml |
D7102S | BeyoNGS™ Tn5 Transposase | 20μl |
D7102M | BeyoNGS™ Tn5 Transposase | 100μl |