碧云天生产的T5 Exonuclease,即T5核酸外切酶,是一种按照5'→3'方向降解双链或单链DNA的核酸外切酶。T5 Exonuclease既能从单链或双链DNA 5'末端起始消化,也可以从线性或环状双链DNA的缺口(gap)或缺刻(nick)处起始消化。T5 Exonuclease无法降解超螺旋双链DNA,并且其降解单链DNA的活性可以通过将反应缓冲液中的Mg2+降低到低于1mM而进行抑制。基于以上特性,T5 Exonuclease常被用于Gibson组装(Gibson Assembly)。
Gibson组装是在恒温条件下,有效连接带有多个重叠序列片段的技术,其基本原理可以概括为三步:(1) T5核酸外切酶从DNA片段的5'末端开始消化,产生互补的单链3'末端(overhangs),促使互补的末端退火;(2) DNA聚合酶填补退火片段的缺口(gaps);(3) DNA连接酶将组装后的切刻(nicks)处进行连接,最后得到一个完整的双链DNA。
碧云天生产的T5 Exonuclease消化线性dsDNA的效果参考图1。
图1. 碧云天生产的T5 Exonuclease消化线性dsDNA的效果图。在50µl反应体系(50mM Potassium Acetate, 20mM Tris-acetate pH 7.9, 10mM Magnesium Acetate, 1mM DTT)中,加入通过PCR扩增产生的1μg 646bp片段,以及图中指定量的本产品或N公司(Competitor)的T5 Exonuclease,37℃孵育10min进行反应,反应完毕后立即置于冰浴,并加入1.2μl 0.5M EDTA以终止反应。取出10μl反应产物,加入2μl 6X DNA Loading Buffer,然后进行2%琼脂糖凝胶电泳检测。如图所示,本产品与N公司的产品相比,具有类似的降解双链线性DNA的效果。
碧云天生产的T5 Exonuclease消化线性ssDNA的效果参考图2。
图2. 碧云天生产的T5 Exonuclease消化线性ssDNA的效果图。在50µl反应体系(50mM Potassium Acetate, 20mM Tris-acetate pH7.9, 10mM Magnesium Acetate, 1mM DTT)中,加入人工合成的1μg 59nt片段,以及图中指定量的本产品或N公司(Competitor)的T5 Exonuclease,37℃孵育30min进行反应,反应完毕后立即置于冰浴,并加入1.2μl 0.5M EDTA以终止反应。取出10μl反应产物,加入2μl 6X DNA Loading Buffer,然后进行7M Urea+15%聚丙烯酰胺凝胶电泳(冰浴条件下用1X TBE作为电泳液,180V电泳120min;之后用D0140 Gel-Red溶液(5000:1)室温染色20min,即可拍照观察结果)。如图所示,本产品与N公司的产品相比,具有类似的降解单链线性DNA的效果。
用途:常用于Gibson组装;降解线性单链、双链DNA或缺刻质粒DNA;从连接的环状双链DNA中去除不完全连接产物;降解线性和缺刻质粒DNA,以获得高纯度的超螺旋质粒DNA;去除碱裂法提取质粒过程中产生的变性质粒DNA;提高小量抽提质粒cDNA文库的转染效率。
来源:纯化自表达T5 噬菌体D15基因质粒的E.coli菌株。
活性定义:One unit is defined as the amount of enzyme required to produce 1 nmol of acid soluble deoxyribonucleotide from double-stranded DNA in 30 minutes at 37 ℃ in a total reaction volume of 50µl.
纯度:不含T5 Exonuclease之外的DNA内切酶和外切酶,不含RNA酶,不含磷酸酯酶。
酶储存液:50mM Tris-HCl (pH7.5, 25℃), 100mM NaCl, 1mM DTT, 0.1mM EDTA, 0.1% (v/v)Triton X-100, 50% (v/v) Glycerol。
10X Reaction Buffer:200mM Tris-acetate (pH7.9, 25℃), 500mM Potassium Acetate, 100mM Magnesium Acetate, 10mM DTT。
失活或抑制:加入EDTA至终浓度为至少11mM或含有SDS的DNA loading buffer (SDS的最终浓度为0.08%)可使T5 Exonuclease失活。
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D7082S-1 | T5 Exonuclease (10U/µl) | 100µl |
D7082S-2 | 10X Reaction Buffer | 600µl |
— | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D7082M-1 | T5 Exonuclease (10U/µl) | 500µl |
D7082M-2 | 10X Reaction Buffer | 1.5ml X2 |
— | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D7082L-1 | T5 Exonuclease (10U/µl) | 2ml |
D7082L-2 | 10X Reaction Buffer | 12ml |
— | 说明书 | 1份 |
-20℃保存,三年有效。
注意事项:T5 Exonuclease是一种对于DNA底物有选择性的核酸外切酶,其对不同的DNA底物显示出不同的反应活性。因此,消化特定的底物时,须注意适当控制好酶量和反应时间。
T5 Exonuclease的最佳反应温度为37℃,但是在50℃也具有一定活性,因此可用于Gibson组装。
T5 Exonuclease在普通PCR buffer中也具有活性。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
Reagent | Volume | Final Concentration |
DNA | xµl | 0.02µg/µl |
Nuclease-free Water | (44-x)µl | - |
10X Reaction buffer | 5µl | 1X |
T5 Exonuclease | 1µl | 0.2U/µl |
Total Volume | 50µl | - |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D0033 | PCR纯化试剂盒/DNA纯化试剂盒 | 50次 |
D0056 | DNA凝胶回收试剂盒 | 50次 |
D7078S | Thermolabile dsDNase | 50次 |
D7078M | Thermolabile dsDNase | 250次 |
D7080S | T7 Endonuclease I (CRISPR等基因突变鉴定用) | 250U |
D7080M | T7 Endonuclease I (CRISPR等基因突变鉴定用) | 1250U |
D7080L | T7 Endonuclease I (CRISPR等基因突变鉴定用) | 5000U |
D7089 | RNase H | 100U |
R7090FT | Thermostable RNase H | 50U |
R7090S | Thermostable RNase H | 250U |
R7090M | Thermostable RNase H | 1000U |
R7090L | Thermostable RNase H | 5000U |
D6053 | BamHI | 2000U |
D6329 | EcoRI | 2000U |
D6389 | HindIII | 2000U |
D6721 | XhoI | 2000U |