T3 RNA Polymerase,即T3 RNA聚合酶,是一种高度特异识别T3启动子序列的DNA依赖的5'→3'RNA聚合酶。T3 RNA
Polymerase可以催化单链或双链DNA T3启动子下游NTP的掺入,合成与T3启动子下游的模板DNA互补的RNA。
特点:T3 RNA Polymerase可以识别修饰的NTP,例如生物素标记、地高辛标记、荧光素标记的NTP,可以用于各种标记RNA的合成。同时对于T3启动子有高度的特异性。
用途:用于RNA合成,合成的RNA可以用于或用作:杂交探针,基因组DNA序列分析,核糖核酸酶保护测定(RNase
protection assay),反义RNA合成,作为体外翻译的RNA模板,RNA剪接研究的底物,RNA二级结构和RNA-蛋白质相互作用,核酸扩增分析,siRNA、miRNA等小RNA。
来源:由大肠杆菌表达,表达基因为嗜菌体T3 RNA Polymerase基因。
活性定义: 37℃60分钟内,催化1nmol AMP掺入到多聚核苷酸中所需的酶量定义为1个活性单位。
活性检测条件:40mM Tris-HCl(pH8.0),6mM MgCl2,10mM DTT,2mM spermidine,0.5mM NTP,
0.6MBq/ml[3H]-ATP,20μg/ml plasmid DNA containing the specific T3 RNA Polymerase promoter sequence。
纯度:不含DNA内切酶和外切酶,不含RNA酶。
酶储存溶液:50mM Tris-HCl(pH8.0),150mM NaCl,5mM DTT,0.1mg/ml BSA,0.5mM Elugent,50% glycerol。
Transcription Buffer(5X):200mM Tris-HCl(pH7.9 at 25℃),30mM MgCl2,50mM DTT,50mM NaCl,10mM
spermidine。
失活或抑制:70℃加热10分钟可使T3 RNA Polymerase失活。加入适量EDTA也可以使T3 RNA Polymerase失活。螯合剂、浓度大于150mM的钠、钾或铵盐可以显著抑制T3 RNA Polymerase的活性。
T3的consensus promotersequence如下:
-15 -10 -5 +1 +5
AATTAACCCTCACTAAAGGGAGA
包装清单:
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D7066-1 | T3 RNA Polymerase(20U/μl) | 500U |
D7066-2 | Transcription Buffer(5X) | 0.2ml |
- | 说明书 | 1份 |
保存条件:
-20℃保存。
注意事项:
酶使用时宜存放在冰盒内或冰浴上,使用完毕后宜立即放置于-20℃保存。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
使用说明:
1. RNA合成:
a. DNA模板经限制性核酸内切酶酶切线性化。
b. 酚/氯仿抽提DNA,用乙醇沉淀后,溶于适量的无菌去离子水中。本步骤也可以使用适当的DNA纯化试剂盒,例如碧云天的
DNA纯化试剂盒(D0033),直接进行纯化,从而免去了酚氯仿抽提和乙醇沉淀这些步骤。
c. 参考如下表格设置反应体系:
Transcription Buffer (5X) | 10μl |
NTP Mixture (10mM each) | 10μl |
线性DNA模板 | 1μg |
Ribonuclease Inhibitor | 50U |
T3 RNA Polymerase | 30U |
补充经DEPC处理的去离子水 | 至50μl |
d. 按上表设置好反应体系后,轻轻混匀(可以用移液器吹打混匀或用Vortex在最低速度轻轻混匀),随后离心沉淀液体。
e. 37℃孵育1~2个小时。
f. 加入2μl 0.5M EDTA (pH 8.0)到反应体系中混匀或-20℃冷却终止反应。
g. 电泳分析转录产物,或通过其他适当方法鉴定转录的效率。
注意:
a) 转录需在无RNA酶条件下进行。
b) 反应体系需在室温条件下配置,4℃有亚精胺(spermidine)存在时DNA可发生沉淀。
c) 按以上反应条件,每1μg 模板DNA可合成超过10μg 的RNA。
d) 如果模板DNA的线形化不太完全,会导致转录出比预期长度更长的RNA,同时使预期长度的转录本比例下降。
e) 可根据实际情况按照比例放大或缩小上述反应体系。
2. 放射标记RNA的合成:
a. DNA模板经限制性核酸内切酶酶切线性化。
b. 酚/氯仿抽提DNA,用乙醇沉淀后,溶于适量的无菌去离子水中。本步骤也可以使用适当的DNA纯化试剂盒,例如碧云天的
DNA纯化试剂盒(D0033),直接进行纯化,从而免去了酚氯仿抽提和乙醇沉淀这些步骤。
c. 参考如下表格设置反应体系:
Transcription Buffer (5X) | 4μl |
3 NTP Mixture (10mM each , without CTP) | 1μl |
100μM CTP | 2.4μl |
[α-32P]-CTP, ~30TBq/mmol(800Ci/mmol) | 1.85MBq(50μCi) |
线性DNA模板 | 0.2~1μg |
Ribonuclease Inhibitor | 20U |
T3 RNA Polymerase | 20U |
补充经DEPC处理的去离子水 | 至20μl |
d. 37℃孵育1~2个小时。
e. -20℃冷却终止反应。
f. 分析和检测RNA的标记效率。
注意:
a) 按以上方法合成的RNA活性一般为3-5 x108dpm/μg。
b) 上述标记反应中也可以使用[32P]、[35S]或[3H]标记的其他NTP。使用其他放射性标记的NTP时,其他的NTP需作相应调整。20μl反应体系各成分推荐使用剂量分别为:1.85MBq(50μCi)5'-[α-32P]-CTP,~30TBq/mmol(800Ci/mmol);11.1MBq(300μCi)5'-[α-35S]-UTP,>37TBq/mmol(>1000Ci/mmol);0.925MBq(25μCi)5,6-[3H]-UTP,1.1-2.2TBq/mmol(30-60Ci/mmol)。
c) 放射性标记NTP浓度低于12μM时,全长转录本合成效率也会下降。
3. 其它用途可以参考上述用途或相关文献资料进行。