碧云天生产的T3 DNA Ligase,即T3 DNA连接酶,是由碧云天自主研发的PerfectProtein™技术平台表达、纯化获得的一种来源于T3噬菌体、ATP依赖型的双链DNA连接酶。T3 DNA Ligase能够有效催化粘性末端和平末端双链DNA分子的连接以及双链DNA或DNA与RNA杂合双链的缺刻修复。缺刻修复时,完整链为DNA,缺刻链5’端和3’端’分别为DNA-DNA、DNA-RNA、RNA-DNA或RNA-RNA都是可以被T3 DNA Ligase修复的,因此T3 DNA Ligase也可以用于生成DNA-RNA和RNA-DNA融合链接的核酸,以及用于基于DNA模板的RNA连接以形成较长的RNA片段。
T3 DNA Ligase能够催化双链DNA中临近的5'磷酸和3'羟基之间形成磷酸二酯键,且对A/T突出末端的连接效率高于C/G末端。
与T4 DNA Ligase相同,在T3 DNA Ligase反应体系中加入PEG6000可以显著提高其对平末端双链DNA的连接效率;而在缺少PEG6000的连接体系中,T3 DNA Ligase对平末端双链DNA分子的连接效率较低。另外,T3 DNA Ligase对NaCl的耐受性是T4 DNA Ligase的2倍,其在1.0M NaCl或KCl的条件下仍可保持95%的活性。因此,在涉及到高离子浓度连接的实验中,T3 DNA Ligase是理想的选择[1,2]。
碧云天生产的T3 DNA Ligase用于进行双链DNA粘性和平末端连接的效果参考图1。
图1. 碧云天生产的T3 DNA Ligase (D7019)与N公司同类产品(Competitor)用于进行双链DNA粘性和平末端连接的效果图。图A为碧云天生产的或N公司(Competitor)的T3 DNA Ligase重组连接产物转化DH5α涂LB平板的实测效果图。利用碧云天生产的BeyoFusion™ DNA Polymerase (D7220),使用一端带有HindIII酶切识别位点,另一端带有SmaⅠ酶切识别位点的引物对靶基因进行PCR扩增,随后使用碧云天HindⅢ (D6389)/SmaⅠ (D6633)对1kb的PCR产物进行双酶切,获得一端带有粘性末端,另一端带有平末端的双链线性DNA分子,作为T3 DNA Ligase催化连接反应的底物。在20µl反应体系(66mM Tris-HCl, 10mM MgCl2, 1mM DTT, 1mM ATP, 7.5% Polyethylene glycol (PEG6000), pH7.6 @25℃)中,加入50ng经PCR扩增及HindⅢ/SmaⅠ双酶切产生的两端分别带有粘性末端和平末端的双链DNA片段,和50ng经HindⅢ/SmaⅠ双酶切线性化的pUC18载体(待插入DNA片段与pUC18载体的摩尔比为3:1),再加入10µl的2X Reaction Buffer以及1μl的本产品或N公司(Competitor)的T3 DNA Ligase,然后用水补至20µl,25℃孵育30分钟进行连接。反应结束后,取5µl连接产物转化DH5α超级感受态细胞(D1031)。图B为菌落PCR鉴定T3 DNA Ligase重组连接构建得到的克隆。实验结果表明,本产品与N公司的产品具有相当的连接粘性末端和平末端双链DNA的效果。菌落PCR鉴定使用的是pUC18载体的通用测序引物:M13 forward sequencing primer (5'-GTAAAACGACGGCCAGT-3')和M13 reverse sequencing primer (5'-CAGGAAACAGCTATGAC-3')。本图仅供参考,实际检测效果可能有所不同。
用途:限制性内切酶切DNA片段的克隆,PCR产物的克隆连接,双链DNA和接头的连接,线性双链DNA的环化,双链DNA的缺刻修复,定点突变,高盐体系的连接,双链DNA缺刻修复,DNA引导的DNA与RNA连接,DNA引导的RNA连接。
来源:纯化自携带编码T3噬菌体DNA ligase的E.coli重组菌株。
活性定义:One unit is defined as the amount of enzyme required to give 50% ligation of 100ng HindIII fragments of λ DNA in a total reaction volume of 20μl in 1 minute at 25℃ in 1X T3 DNA Ligase Reaction Buffer.
纯度:不含除T3 DNA Ligase之外的其它种类的DNA连接酶,不含内切酶和外切酶,不含RNA酶,不含磷酸酯酶。
酶储存液:10mM Tris-HCl, 50mM KCl, 1mM DTT, 0.1mM EDTA, 50% Glycerol (pH7.4 @25℃)。
2X Reaction Buffer:132mM Tris-HCl, 20mM MgCl2, 2mM DTT, 2mM ATP, 15% Polyethylene glycol (PEG6000) (pH7.6 @25℃)。
失活或抑制:在不含有PEG6000的反应体系中65℃孵育10分钟。
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D7019S-1 | T3 DNA Ligase (3kU/μl) | 50µl |
D7019S-2 | 2X Reaction Buffer | 500µl |
— | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D7019M-1 | T3 DNA Ligase (3kU/μl) | 200µl |
D7019M-2 | 2X Reaction Buffer | 2ml |
— | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D7019L-1 | T3 DNA Ligase (3kU/μl) | 1ml |
D7019L-2 | 2X Reaction Buffer | 10ml |
— | 说明书 | 1份 |
-20℃保存,两年有效。
注意事项:ATP是T3 DNA Ligase发挥催化活性所必需的辅助因子,而不是像E.coli DNA Ligase以NAD作为辅助因子的。因此连接反应体系中一定要保持终浓度为1mM的ATP。本产品提供的2X Reaction Buffer中已经包含了ATP和连接粘末端所需的PEG6000。
T3 DNA Ligase的催化底物是双链DNA或完整链为DNA的缺刻双链,不能直接用于单链DNA或RNA的连接反应,但可以用于DNA模板引导的单链DNA之间、单链RNA之间或单链DNA与单链RNA之间的连接。
T3 DNA Ligase的反应体系中含有7.5% PEG6000。如果后续实验体系不兼容PEG6000,可考虑自行配制不含PEG6000的连接反应缓冲液,或者使用T4 DNA Ligase (D7006)的连接缓冲体系,同时注意添加终浓度为1mM的ATP,但T3 DNA Ligase连接酶在T4 DNA Ligase (D7006)的连接缓冲体系中的活性会降低约10倍。
在不含PEG的反应体系中,T3 DNA Ligase可进行热失活。如果反应体系中含有PEG6000,T3 DNA Ligase不能进行热失活,否则会显著降低后续的转化效率。
如果连接体系中需要维持高浓度NaCl,建议使用不含PEG6000的缓冲液。
在标准的载体与片段连接的20μl反应体系中,通常需要在25℃下反应30分钟。
反应体系所需的超纯水推荐使用BeyoPure™ Ultrapure Water (DNase/RNase-Free, Sterile) (ST876)。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
Reagent | Volume |
2X Reaction Buffer | 10µl |
Vector DNA | Xμl (0.020pmol) |
Insert DNA | Yμl (0.060pmol) |
Ultrapure Water | (9-X-Y)μl |
T3 DNA Ligase (3kU/μl) | 1µl |
Total Volume | 20µl |