碧云天生产的Endonuclease VIII,即核酸内切酶VIII,来自大肠杆菌,是由碧云天自主研发的PerfectProtein™技术平台表达、纯化获得的重组内切酶。Endonuclease VIII是一种DNA损伤修复酶,具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。Endonuclease VIII的N-糖基化酶活性能切下并释放双链DNA上受损的嘧啶碱基(Pyrimidines)从而产生一个脱嘌呤(Apurinic, AP)位点;Endonuclease VIII的AP裂解酶活性,可以切割AP位点的3'和5'端,从而切除AP位点,产生一个具有3'和5'磷酸的碱基缺口(Gap)。
可以被Endonuclease VIII识别并切除的受损碱基包括:Urea、5,6-dihydroxythymine (5,6-二羟基胸腺嘧啶)、Thymine glycol (胸腺嘧啶乙二醇)、5-hydroxy-5-methylhydantoin (5-羟基-5-甲内酰脲)、Uracil glycol (尿嘧啶乙二醇)、6-hydroxy-5,6-dihydrothymine (6-羟基-5,6-二氢胸腺嘧啶)和Methyltartronylurea (甲基羟丙二酰脲) [1,2]。虽然Endonuclease VIII与Endonuclease III相似,但Endonuclease VIII具有β和δ裂解酶活性,而Endonuclease III仅具有β裂解酶活性。
本产品识别并切除双链DNA上受损碱基的原理请参考图1。
图1. Endonuclease VIII识别并切除双链DNA上受损碱基的示意图。Endonuclease VIII识别双链DNA上受损碱基并在其N-糖基化酶活性作用下切除双链DNA上受损的嘧啶碱基,产生一个脱嘌呤(AP)位点;随后在其AP裂解酶活性作用下切割AP位点的3'和5'端切除AP位点,产生一个具有3'和5'磷酸的碱基缺口。
碧云天生产的Endonuclease VIII催化酶切含AP位点双链DNA的效果请参考图2。
图2. 碧云天生产的Endonuclease VIII (D6781)和国外N公司的同类产品(Competitor)催化切除含AP位点双链DNA的效果图。在20µl反应体系中加入图中指定量的本产品或N公司的Endonuclease VIII,37℃孵育30分钟进行损伤位点切除反应,反应完毕后立即放至冰上,并加入2X RNA Loading Buffer (R0215),随后用BeyoGel™ TBE-Urea PAGE预制胶(15%) (R0243/R0244)进行电泳分析,最终进行核酸染色和荧光成像分析。如图所示,本产品与N公司的产品相比,具有类似的催化效果。反应体系(20μl):10mM Tris-HCl, 75mM NaCl, 1mM EDTA, pH 8 @ 25℃, 20pmol含AP位点的双链DNA以及不同浓度的Endonuclease VIII。含AP位点的双链DNA的制备方法:将含dU碱基的DNA 1 (31nt)和正常的DNA 2 (27nt)按照Annealing Buffer for DNA Oligos (5X) (D0251)说明书中的使用方法通过梯度降温退火形成双链DNA;随后使用Uracil-DNA Glycosylase (E. coli) (D7360)/Uracil-DNA Glycosylase (Heat-labile, Bacterium) (D7362)/Uracil-DNA Glycosylase (Heat-labile, Cod) (D7364)催化含尿嘧啶的DNA链中的尿嘧啶(dU)碱基和脱氧核糖之间的N-糖苷键发生水解,从而释放游离尿嘧啶产生含AP位点的双链DNA。实际检测效果会因实验条件、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。
用途:可用于DNA损伤和修复研究;单细胞凝胶电泳;碱洗脱;碱解螺旋;识别并切除双链DNA上受损的嘧啶碱基;切割AP位点的3'和5'端而产生一个具有3'和5'磷酸的碱基缺口(Gap)。
来源:由大肠杆菌表达纯化而获得。
活性单位定义:One unit is defined as the amount of enzyme required to cleave 1pmol of a 34 mer oligonucleotide duplex containing a single AP site in a total reaction volume of 10μl in 1 hour at 37℃ in 1X Endonuclease VIII Reaction Buffer containing 10pmol of fluorescently labeled oligonucleotide duplex.
纯度:大于95%,无DNA内切酶和其他外切酶活性,无RNA酶活性。
酶储存溶液:10mM Tris-HCl (pH8 @ 25℃), 250mM NaCl, 0.1mM EDTA, 1mM DTT, 50% (v/v) Glycerol.
失活或抑制:75℃加热10分钟可使Endonuclease VIII失活。
10X Endonuclease VIII Buffer:100mM Tris-HCl, 750mM NaCl, 10mM EDTA, pH 8 @ 25℃.
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D6781S-1 | Endonuclease VIII (10U/µl) | 100µl |
D6781S-2 | 10X Endonuclease VIII Buffer | 0.4ml |
— | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D6781M-1 | Endonuclease VIII (10U/µl) | 500µl |
D6781M-2 | 10X Endonuclease VIII Buffer | 2ml |
— | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D6781L-1 | Endonuclease VIII (10U/µl) | 2ml |
D6781L-2 | 10X Endonuclease VIII Buffer | 8ml |
— | 说明书 | 1份 |
-20℃保存,至少两年有效。
注意事项:本产品中在使用时宜存放在冰盒内或冰浴上,使用完毕后宜立即放置于-20℃保存。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
Component | Volume |
Ultrapure Water (DNase/RNase-Free, Sterile) | 15µl |
10X Endonuclease VIII Buffer | 2µl |
dsDNA with AP site (10µM/µl) | 2µl |
Endonuclease VIII (10U/µl) | 1µl |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D0251 | Annealing Buffer for DNA Oligos (5X) | 1ml |
D7360S | Uracil-DNA Glycosylase (E. coli) | 1000U |
D7360M | Uracil-DNA Glycosylase (E. coli) | 5000U |
D7362S | Uracil-DNA Glycosylase (Heat-labile, Bacterium) | 100U |
D7362M | Uracil-DNA Glycosylase (Heat-labile, Bacterium) | 500U |
D7364S | Uracil-DNA Glycosylase (Heat-labile, Cod) | 200U |
D7364M | Uracil-DNA Glycosylase (Heat-labile, Cod) | 1000U |
D7364L | Uracil-DNA Glycosylase (Heat-labile, Cod) | 5000U |
D7359-1ml | dUTP (100mM) | 1ml |
D7359-250μl | dUTP (100mM) | 250μl |
D6781S | Endonuclease VIII | 1kU |
D6781M | Endonuclease VIII | 5kU |
D6781L | Endonuclease VIII | 20kU |
R0215-1ml | 2X RNA Loading Buffer | 1ml |
ST876-100ml | BeyoPure™ Ultrapure Water (DNase/RNase-Free, Sterile) | 100ml |
ST876-500ml | BeyoPure™ Ultrapure Water (DNase/RNase-Free, Sterile) | 500ml |