SgeI
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产品编号 D6619L
数量
¥ 1998.00
产品包装:
250U 1kU 5kU
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碧云天自主研发生产的SgeI,是从大肠杆菌表达纯化获得的一种修饰依赖型限制性内切酶,其基本信息如下:

识别序列[1] 缓冲液兼容性(%) 酶切温度 失活条件 甲基化干扰?
5'-m5CNNG(N)9^-3' 1X SgeI 1X B 1X G 1X O 1X R 1X Y 2X Y 37ºC 65ºC
20min
有时有干扰
3'-GNNC(N)13^-5' 100 0-20 0-20 0-20 NR* NR* NR*

*,Star activity,当酶量3倍或以上过量时会产生星号活性,即产生非特异性酶活性。

NR,不推荐使用这种缓冲液,会产生很高的星号活性。

SgeI可切割在单链或双链DNA上含有5-甲基胞嘧啶的DNA靶标。SgeI限制性内切酶可识别m5CNNG(9/13)^位点,并于37ºC下在其独特的缓冲液中的切割效果最佳。为确保一致的性能,该酶稀释液中包含预混合BSA,其可增强酶的稳定性,并与DNA制剂中可能存在的污染物相结合。

碧云天生产的SgeI酶切DNA双链的效果请参考图1。

图1. 碧云天生产的SgeI (D6619)和国外同类产品(Competitor)的酶活性检测效果对比图。使用本产品或国外T公司的SgeI,在20µl反应体系中加入图中指定量的本产品或国外T公司的SgeI,在1X SgeI Buffer中酶切400ng含6个SgeI位点的pBR322质粒(D2301) (Dcm+),37ºC孵育1小时进行酶切反应,酶切产物为多个长度不相等的DNA片段,随后65ºC孵育20分钟进行失活,然后电泳并进行核酸染色和荧光成像分析。如图所示,本产品与T公司的产品相比,具有类似的酶切效果。M, DNA marker (DNA Ladder (0.2-12 kb, 12 bands) (D0110))。实际检测效果会因实验条件、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。

酶储存液组成为:10mM Tris-HCl (pH7.4 at 25ºC), 100mM NaCl, 1mM DTT, 1mM EDTA, 50% Glycerol.

酶稀释液组成为:10mM Tris-HCl (pH7.4 at 25ºC), 100mM KCl, 1mM DTT, 1mM EDTA, 0.2mg/ml BSA, 50% Glycerol.

1X SgeI Buffer组成为:10mM Tris-HCl (pH8.0 at 25ºC), 5mM MgCl2, 100mM KCl, 0.02% Triton X-100, 0.1mg/ml BSA.

酶性单位定义:One unit is defined as the amount of SgeI required to digest 1µg of pBR322 DNA isolated from E.coli Dcm+ strain in 1 hour at 37ºC in a total reaction volume of 50µl.

质量控制:(1) 核酸内切酶残留检测:将3U SgeI与超螺旋质粒DNA在37ºC温育4h,通过DNA电泳检测质粒无变化。(2) 核酸外切酶残留检测:将3U SgeI与双链DNA底物在37ºC温育1h,通过DNA电泳检测双链DNA底物无变化。

SgeI内切酶识别位点的甲基化影响请参考下表:

Dam Dcm CpG EcoKI EcoBI
无影响 总是切割被Dcm甲基转移酶甲基化的DNA 切割与CpG甲基化序列重叠的靶点 无影响 无影响
包装清单:
产品编号 产品名称 包装
D6619S-1 SgeI (3U/µl) 85μl
D6619S-2 10X SgeI Buffer 340μl
说明书 1份

产品编号 产品名称 包装
D6619M-1 SgeI (3U/µl) 335μl
D6619M-2 10X SgeI Buffer 1.34ml
说明书 1份

产品编号 产品名称 包装
D6619L-1 SgeI (3U/µl) 1.67ml
D6619L-2 10X SgeI Buffer 6.68ml
说明书 1份
保存条件:

-20ºC保存,至少两年有效。

注意事项:

内切酶使用时宜存放在冰盒内或冰浴上,使用完毕后宜立即放置于-20ºC保存。

底物至少需要2个SgeI识别序列才能有效酶切。

甲基化DNA完全酶切取决于SgeI的识别位点的数量,另外由于识别位点酶切产生的DNA产物会促进SgeI的非特异性酶切,因此,建议酶切时优化SgeI酶量用于酶切反应。

长时间酶切不稳定,具有星形活性,建议酶切时优化SgeI酶切时间。

不含核酸酶的超纯水推荐选购碧云天的BeyoPure™ Ultrapure Water (DNase/RNase-Free, Sterile) (ST876)。

如果发现预期的酶切位点不能切开,请确认是否存在甲基化干扰问题。

同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性,遇到可能存在甲基化干扰问题时,可以尝试同裂酶。

本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。

为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

使用说明:
1. 单酶切时可以参考如下反应体系,在冰浴上进行操作。
Reagent Plasmid DNA
Ultrapure Water to 20µl
10X SgeI Buffer 2µl
Substrate DNA xµl (up to 0.5-2µg)
SgeI 0.2-1µl
Total volume 20µl
Incubate at 37ºC for 1h
注:反应体系可以按比例放大或缩小。反应时间不建议超过1h。
a. 参考上表依次加入各种液体后,用移液器轻柔吸打或轻弹管壁以混匀(切勿涡旋混合),然后瞬时离心以沉降液体至管底。
b. 37ºC温育1h。酶切反应时优先推荐使用水浴,反应温度通常更加恒定一些。
c. 65ºC温育20min即可使酶失活并停止反应(可选)。
2. 双或多酶切时可以在参考上表单酶切反应体系设置的基础上,参考如下原则设置反应体系。
a. 每种内切酶的用量为1μl,并根据需要适当扩大反应体系;
b. 所有内切酶的体积总和不得超过总反应体系的1/10;
c. 如果所用的几种内切酶的最适反应温度不同,应先从最适温度低的酶开始酶切,再添加最适温度较高的酶,在其最适反应温度下进行酶切反应。
参考文献:
1. Loenen WA, Raleigh EA. Nucleic Acids Res. 2014. 42(1):56-69.
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