pCMV-N-3X Flag-SUMOEU1-MCS-Avi (Avi标签质粒)
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pCMV-N-3X Flag-SUMOEU1-MCS-Avi是碧云天自行研发的用于在哺乳动物细胞中表达可被生物素标记的目的蛋白的质粒。该质粒由CMV启动子驱动带有3X Flag标签(3X Flag tag)、SUMOEU1标签(SUMOEU1 tag)及Avi标签(Avi tag)的目的蛋白。在生物素连接酶(Biotin ligase) BirA、ATP和生物素(Biotin)存在的体外条件下,BirA催化生物素共价结合到目的蛋白的Avi标签上,从而对目的蛋白进行生物素标记。同时,本质粒带有SUMOEU1标签,可被rSENPEUH蛋白酶特异性的识别并切割,从而实现相应标签蛋白与目的蛋白的高效分离。

Avi标签是由15个氨基酸(GLNDIFEAQKIEWHE)组成的短肽标签,在ATP和生物素存在的条件下,BirA在Avi标签的赖氨酸残基上连接一个生物素,从而实现目的蛋白的生物素标记[1]。

生物素连接酶BirA特异性生物素标记Avi-tag有多方面的优点。Avi标签小且对融合蛋白的影响非常小,只针对Avi标签上的Lys残基进行特定位置的生物素标记,生物素标记效率高,可重复性好;体内或体外均可进行标记,标记后的蛋白与链霉亲和素(Streptavidin)的亲和力高,从而使Avi-tag技术可以应用于目的蛋白的固定吸附、纯化和检测等;相比于传统生物素化学标记的非特异性位点的标记,BirA催化的反应条件更温和,对被标记蛋白活力影响小,酶活效率高,标记特异性强[1]。

类泛素蛋白修饰分子(Small ubiquitin-like modifier, SUMO),也被称为泛素样修饰因子小蛋白、泛素样小分子修饰因子或小泛素相关修饰物,是广泛存在于真核生物的蛋白家族。和泛素化(Ubiquitination)类似,类泛素蛋白修饰分子通过类泛素蛋白(Ubiquitin-like proteins, Ubls)活化酶(Ubl activating enzyme, E1)、结合酶(Ubl conjugating enzyme, E2)和连接酶(Ubl protein ligase, E3)共价连接到特定蛋白的赖氨酸上,这一过程被称为SUMO化修饰(SUMOylation)。SUMO化修饰是一种翻译后修饰,参与细胞的调控,如细胞核到细胞膜的运输、转录调控、细胞凋亡、蛋白质的稳定、压力应激和细胞周期的调控等[2]。

SUMOEU1标签作为SUMO的突变体,在真核细胞中可以提高目的蛋白的可溶性和稳定性,但是SUMOEU1标签融合的目的蛋白不参于SUMO相关的细胞调控,也不会被内源性的去泛素化酶切割。SUMOEU1标签在体外可以被rSENPEUH蛋白酶特异性的识别并切割,从而实现3X Flag标签、SUMOEU1标签与目的蛋白的高效分离,切割后的目的蛋白不带有任何相应标签氨基酸的残留,因此SUMOEU1标签适用于真核细胞重组蛋白的表达和纯化[3]。

内部核糖体进入位点序列(Internal ribosome entry site, IRES)是一段茎环结构序列,在上游启动子的控制下IRES连接的两个基因转录成为一条mRNA,在翻译时IRES可以单独招募核糖体,实现IRES上、下游两个不同基因的共表达。通常下游基因的表达要相对弱一些。

本质粒为氨苄青霉素(Ampicillin)抗性和新霉素(Neomycin)抗性,可利用其氨苄青霉素抗性转化大肠杆菌后筛选阳性菌。而在转染哺乳动物细胞后,可使用G418 (ST081)筛选稳定表达目的蛋白的细胞株。G418和新霉素效果一致,但G418的细胞毒性更低。

本质粒在N端3X Flag标签与SUMOEU1标签之间含有HRV 3C蛋白酶识别的八肽序列Leu-Glu-Val-Leu-Phe-Gln-Gly-Pro,因此可在目的蛋白纯化后用HRV 3C蛋白酶切除N端的3X Flag标签。由于HRV 3C蛋白酶酶切发生在八肽序列的Gln和Gly之间,所以在酶切去除3X Flag标签的时候目的蛋白的N端会留下两个额外的氨基酸残基Gly和Pro。

pCMV-N-3X Flag-SUMOEU1-MCS-Avi质粒的主要信息如下:

Feature Nucleotide Position
CMV promoter 50-633
3X Flag tag 739-804
HRV 3C site 823-846
SUMOEU1 tag 847-1119
Multiple cloning site 1117-1146
Avi tag 1147-1191
WPRE 1249-1837
HSV-thymidine Kinase (TK) poly(A) signal 1903-1951
f1 ori 2153-2581
SV40 ori 2775-2910
Neomycin 2991-3785
SV40 poly(A) signal 3961-4082
lac operator 4155-4171
CAP binding site 4224-4245
ori 4533-5121
Ampicillin 5292-6152

pCMV-N-3X Flag-SUMOEU1-MCS-Avi质粒(6473bp)的图谱如下:

pCMV-N-3X Flag-SUMOEU1-MCS-Avi表达基因的详细图谱见说明书:https://www.beyotime.com/Manual/D2979 pCMV-N-3X Flag-SUMO_EU1-MCS-Avi (Avi标签质粒).pdf

pCMV-N-3X Flag-SUMOEU1-MCS-Avi中没有的酶切位点包括:

AarI AbsI Acc65I AcvI AfeI AflII AgeI
AjiI AjuI AleI Aor51HI AscI AsiGI AsiSI
Asp718I AsuII AsuNHI AxyI BaeI BanIII BarI
BbrPI BbvCI BfrI BlpI BmgBI BmtI BoxI
Bpu14I Bpu1102I Bsa29I Bse21I BseCI BsgI BshVI
BshTI BsiWI Bsp119I Bsp1407I Bsp1720I BspDI BspOI
BspTI BspT104I BspXI BsrGI Bst98I BstAFI BstAUI
BstBI BstEII BstENI BstHPI BstPI BstPAI BstXI
Bsu15I Bsu36I BsuTUI BtrI CelII ClaI Csp45I
CspAI Eco47III Eco72I Eco81I Eco91I EcoNI EcoO65I
FseI FspAI HindIII HpaI I-CeuI I-PpoI I-SceI
KflI KpnI KspAI MauBI MreI MspCI MssI
Nb.BbvCI NheI NspV Nt.BbvCI OliI PacI PalAI
Pfl23II PI-PspI PI-SceI PinAI PmaCI PmeI PmlI
PpuMI PshAI Psp5II PspCI PspEI PspLI PspPPI
PsrI RgaI RigI SanDI SbfI SdaI SfaAI
SfiI SfuI SgfI SgrAI SgsI SmiI SrfI
Sse8387I SspBI SwaI TstI Vha464I XagI XcmI

pCMV-N-3X Flag-SUMOEU1-MCS-Avi中的单酶切位点包括:

ApaI G,GGCC`C 844 PciI A`CATG,T 4472
AvrII C`CTAG,G 2909 PflFI GACN`N,NGTC 3237
BamHI G`GATC,C 1117 PluTI G,GCGC`C 3122
BclI T`GATC,A 2960 PspOMI G`GGCC,C 840
Bpu10I CC`TNA,GC 6468 PspXI VC`TCGA,GB 1135
BsmI GAATG,CN` 4041 PstI C,TGCA`G 3172
BsmBI CGTCTCN`NNNN, 654 PvuI CG,AT`CG 5735
BspEI T`CCGG,A 716 RsrII CG`GWC,CG 3635
BssHII G`CGCG,C 3516 SacI G,AGCT`C 633
BstZ17I GTA|TAC 4093 SacII CC,GC`GG 1752
DraIII CAC,NNN`GTG 2386 SexAI A`CCWGG,T 2676
Eco53kI GAG|CTC 631 SfoI GGC|GCC 3120
EcoRI G`AATT,C 724 SgrDI CG`TCGA,CG 6286
EcoRV GAT|ATC 1240 SmaI CCC|GGG 2932
Esp3I CGTCTCN`NNNN, 654 SnaBI TAC|GTA 405
KasI G`GCGC,C 3118 SspI AAT|ATT 6169
MfeI C`AATT,G 6449 StuI AGG|CCT 2908
MluI A`CGCG,T 43 TspMI C`CCGG,G 2930
MscI TGG|CCA 3201 Tth111I GACN`N,NGTC 3237
NarI GG`CG,CC 3119 XbaI T`CTAG,A 1129
NdeI CA`TA,TG 299 XhoI C`TCGA,G 1135
NotI GC`GGCC,GC 1199 XmaI C`CCGG,G 2930
PaeR7I C`TCGA,G 1135

pCMV-N-3X Flag-SUMOEU1-MCS-Avi质粒中推荐使用的测序引物序列如下:

CMV-F (584-603): 5'-CGCAAATGGGCGGTAGGCGT-3'

pCMV-N-3X Flag-SUMOEU1-MCS-Avi的全序列信息请: D2979 pCMV-N-3X Flag-SUMO_EU1-MCS-Avi (Avi标签质粒).txt

包装清单:
产品编号 产品名称 包装
D2979-1µg pCMV-N-3X Flag-SUMOEU1-MCS-Avi 1µg
D2979-100µg pCMV-N-3X Flag-SUMOEU1-MCS-Avi 100µg
说明书 1份
保存条件:

-20℃保存。

注意事项:

本质粒未经碧云天书面许可不得用于任何商业用途,也不得移交给订货人所在实验室外的任何个人或单位。

本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。

为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

使用说明:
1. 首次使用1µg包装的本产品时,请先取少量本质粒转化大肠杆菌,进行质粒小量、中量或大量抽提后再用于后续用途。抽提获得的质粒可以通过酶切电泳进行鉴定,或通过测序进行鉴定。
2. 100µg包装的本产品质粒浓度为0.1µg/µl,共1ml。可以直接用于酶切或者转染细胞。
参考文献:
1. Millard G.Cull, Peter J.Schatz. Methods in Enzymology. 2000. Volume 326:430-440.
2. Hay RT. Mol Cell. 2005. 18(1):1-12.
3. Vera Rodriguez A, Frey S and Gorlich D. J Cell Biol. 2019. 218(6):2006-2020.
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