pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc是碧云天自行研发的哺乳动物细胞表达质粒,用于表达C端带有Myc标签(EQKLISEEDL)的新冠病毒(SARS-CoV-2) 核衣壳(Nucleocapsid, N)蛋白,可以使用抗Myc标签的抗体来识别N蛋白的表达,或进行免疫共沉淀分析等。该质粒含有CMV启动子,可以高效启动目的蛋白在细胞中的表达,质粒为氨苄青霉素抗性。
N蛋白是冠状病毒的四个结构蛋白之一,由N基因编码,为核衣壳磷酸蛋白(nucleocapsid phosphoprotein),是冠状病毒的主要结构蛋白,也是冠状病毒编码蛋白中表达丰度最高的蛋白。N蛋白在病毒的组装、释放以及病毒的致病性方面发挥重要作用。冠状病毒N蛋白功能相对保守,包含两个结构独立的RNA结合结构域:N端RNA结合结构域(N-terminal RNA binding domain,NTD)和C端结构域(C-terminal domain,CTD),中间还有一个丝氨酸和精氨酸富集的连接区(serine and arginine linker region, SR linker)。冠状病毒的N蛋白能与病毒RNA紧密结合,通过螺旋堆积将RNA包装,从而保护病毒的基因组RNA。在病毒感染过程中,N蛋白是所有结构蛋白中诱导免疫反应最强烈的蛋白,由于其分子量小,没有糖基化修饰,易于蛋白表达纯化,因此常作为冠状病毒血清学检查最为合适的抗原。
pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc质粒的主要信息如下:
Feature Nucleotide | Position |
CMV promoter | 232-819 |
T7 promoter and T7 primer binding site | 863-882 |
Multiple cloning site | 895-922 |
N protein | 923-2179 |
Myc-tag | 2180-2209 |
BGH pA | 2250-2474 |
f1 origin of ss-DNA replication | 2520-2948 |
SV40 promoter | 2953-3296 |
Neomycin resistance ORF | 3358-4152 |
SV40 polyA signal | 4326-4456 |
pUC origin | 4839-5509 |
Ampicillin resistance ORF | 5654-6650 |
bla promoter | 6549-6555 |
pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc质粒(6650bp)的图谱如下:
pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc的多克隆位点的详细图谱见说明书:https://www.beyotime.com/Manual/D2943 pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc.pdf
pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc中没有的酶切位点(Restriction enzymes that do not cut pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc)包括:
AgeI | AleI | AscI | AsiSI | BaeI | BamHI | BlpI |
BsgI | BsiWI | BsmBI | BspDI | BspEI | BsrGI | BstEII |
Bsu36I | ClaI | EcoNI | EcoRV | Esp3I | FseI | HpaI |
NotI | PacI | PmlI | PpuMI | PshAI | SacII | SbfI |
SfiI | SgrAI | SrfI | SwaI |
pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N中的单酶切位点(Restriction enzymes that cut pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc)包括:
Acc65I | G`GTAC,C | 917 | NarI | GG`CG,CC | 3486 |
AfeI | AGC|GCT | 1852 | NheI | G`CTAG,C | 895 |
AflII | C`TTAA,G | 908 | NruI | TCG|CGA | 208 |
AhdI | GACNN,N`NNGTC | 5727 | PaeR7I | C`TCGA,G | 1122 |
ApaI | G,GGCC`C | 2223 | PciI | A`CATG,T | 4837 |
BbvCI | CC`TCA,GC | 1677 | PflMI | CCAN,NNN`NTGG | 1277 |
BcgI | ,NN`(N)10CGA(N)6TGC(N)10,NN` | 6232 | PluTI | G,GCGC`C | 3489 |
BmgBI | CAC|GTC | 1751 | PspOMI | G`GGCC,C | 2219 |
BmtI | G,CTAG`C | 899 | PspXI | VC`TCGA,GB | 1122 |
BsaBI | GATNN|NNATC | 3345 | PvuI | CG,AT`CG | 6097 |
BseRI | GAGGAG(N)8,NN` | 3272 | RsrII | CG`GWC,CG | 4002 |
BsmI | GAATG,CN` | 4406 | SacI | G,AGCT`C | 818 |
BssHII | G`CGCG,C | 3883 | ScaI | AGT|ACT | 6207 |
BstBI | TT`CG,AA | 4168 | SexAI | A`CCWGG,T | 3043 |
BstXI | CCAN,NNNN`NTGG | 1936 | SfoI | GGC|GCC | 3487 |
BstZ17I | GTA|TAC | 4458 | SmaI | CCC|GGG | 3299 |
CspCI | ,NN` (N)11CAA(N)5GTGG(N)10,NN` | 626 | SnaBI | TAC|GTA | 590 |
DraIII | CAC,NNN`GTG | 2753 | SpeI | A`CTAG,T | 249 |
EagI | C`GGCC,G | 3392 | SspI | AAT|ATT | 6531 |
Eco53kI | GAG|CTC | 816 | StuI | AGG|CCT | 3275 |
EcoO109I | RG`GNC,CY | 2219 | TspMI | C`CCGG,G | 3297 |
EcoRI | G`AATT,C | 1200 | XbaI | T`CTAG,A | 2213 |
KasI | G`GCGC,C | 3485 | XcmI | CCANNNN,N`NNNNTGG | 1775 |
KpnI | G,GTAC`C | 921 | XhoI | C`TCGA,G | 1122 |
MluI | A`CGCG,T | 228 | XmaI | C`CCGG,G | 3297 |
MscI | TGG|CCA | 3568 |
pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc质粒中推荐使用的测序引物序列如下:
pcDNA3.1 primer (829-848): 5'- CTAGAGAACCCACTGCTTAC -3'
BGH pA primer (2244-2261): 5'- TAGAAGGCACAGTCGAGG -3'
pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc的全序列信息: D2943 pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc序列.txt。
pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc质粒转染HEK293T细胞后的表达效果请参考图1:
图1:Western blot实验检测SARS-CoV-2 N基因在HEK293T细胞的表达。1.转染pcDNA3.1空载质粒;2.转染pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc质粒。使用碧云天Lipo8000™转染试剂(C0533)将2µg pcDNA3.1或pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc质粒转染六孔板中密度为80%左右的HEK293T细胞,37℃恒温培养48h后,弃掉孔内培养液,PBS洗涤三遍后加入150µl Western及IP细胞裂解液(P0013)充分裂解,4℃离心,取上清用BCA法测蛋白浓度,然后经浓度4-20%的预制胶(P0524)电泳,每孔蛋白总量20µg,转膜、封闭后使用1:1000稀释的Myc抗体(AM926)室温孵育1h,洗涤后1:1000稀释的二抗(A0192)室温孵育1h,最后经BeyoELC Star(P0018AS)化学发光,并使用BeyoImager™ 600化学发光成像系统(EI600)拍照记录。
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D2943-1μg | pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc | 1μg |
D2943-100μg | pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc | 100μg |
— | 说明书 | 1份 |
-20℃保存。
注意事项:本质粒未经碧云天书面许可不得用于任何商业用途,也不得移交给订货人所在实验室外的任何个人或单位。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D2941-1µg | pcDNA3.1-SARS-CoV-2-M-Myc | 1µg |
D2941-100µg | pcDNA3.1-SARS-CoV-2-M-Myc | 100µg |
D2943-1µg | pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc | 1µg |
D2943-100µg | pcDNA3.1-SARS-CoV-2-N-Myc | 100µg |
D2945-1µg | pcDNA3.1-SARS-CoV-2-Spike-Myc | 1µg |
D2945-100µg | pcDNA3.1-SARS-CoV-2- Spike -Myc | 100µg |
D2947-1µg | pCMV-SARS-CoV-2-E-Myc | 1µg |
D2947-100µg | pCMV-SARS-CoV-2-E-Myc | 100µg |
D2949-1µg | pcDNA3.1-ACE2 -Flag | 1µg |
D2949-100µg | pcDNA3.1-ACE2 -Flag | 100µg |
D2951-1µg | pcDNA3.1-ACE2(1-615) -His | 1µg |
D2951-100µg | pcDNA3.1-ACE2(1-615) - His | 100µg |
D2953-1µg | pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp) | 1µg |
D2953-100µg | pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp) | 100µg |