pCMV-Cre-EGFP是碧云天自行研发的含有CMV启动子的用于在哺乳动物细胞中表达带有EGFP (Enhanced Green Fluorescent Protein, 增强绿色荧光蛋白)标签的Cre Recombinase (Cre重组酶)的表达质粒。来自条件性基因敲除(Conditional gene knockout) 小鼠等含有预先插入loxP位点的细胞在转染本质粒后,本质粒表达的Cre Recombinase可以导致两个loxP位点间的基因删除,从而实现条件性基因敲除。
Cre重组酶是来源于大肠杆菌噬菌体P1的一种类型I的拓朴异构酶(Type I topoisomerase),也是一种酪氨酸重组酶(tyrosine recombinase),它可识别34bp的loxP位点(两端为两个13bp的反向重复序列(inverted repeats),中间是8bp的间隔区(图1)并催化loxP位点之间的DNA发生重组;重组产物根据loxP位点的位置和相对方向的不同而不同,两个含单loxP位点的DNA将发生融合:两个正向重复的loxP位点间的DNA将以环状形式被切割,而两个反向loxP位点间的DNA序列将被翻转(图2)。
图2. Cre-loxP位点特异性重组示意图。
pCMV-Cre-EGFP质粒转染HeLa细胞后的荧光表达效果,可以看到EGFP标签的Cre重组酶主要分布在细胞核中(图3)。
图3. pCMV-Cre-EGFP质粒转染HeLa细胞后的表达效果图。左图为明场照片,中图为荧光照片,右图为叠加照片。
本质粒为卡那霉素抗性,转染细胞后,可使用G418筛选稳定表达目的蛋白的细胞株。
pCMV-Cre-EGFP质粒的主要信息如下:
Feature Nucleotide | Position |
CMV promoter | 1-602 |
T3 promoter and T3 primer binding site | 620-639 |
Cre recombinase | 677-1705 |
EGFP | 1718-2437 |
multiple cloning site | 2349-2497 |
T7 promoter and T7 primer binding site | 2541-2562 |
SV40 polyA signal | 2574-2957 |
f1 origin of ss-DNA replication | 3095-3399 |
bla promoter | 3424-3548 |
SV40 promoter | 3568-3906 |
neomycin/kanamycin resistance ORF | 3941-4732 |
HSV-thymidine kinase (TK) polyA signal | 4733-5191 |
pUC origin | 5320-5987 |
pCMV-Cre-EGFP质粒(6039bp)的图谱如下:
pCMV-Cre-EGFP的详细图谱见说明书:https://www.beyotime.com/Manual/D2608 pCMV-Cre-EGFP.pdf
pCMV-Cre-EGFP中没有的酶切位点(Restriction enzymes that do not cut pCMV-Cre-EGFP)包括:
AflII | AhdI | AscI | BaeI | BbsI | BbvCI | BlpI |
BmgBI | BsiWI | BspEI | BspQI | BstEII | BstXI | BstZ17I |
EarI | EcoNI | FseI | NotI | PflMI | PmeI | PmlI |
PpuMI | PspXI | SacII | SapI | SbfI | ScaI | SgrAI |
SmaI | SrfI | SwaI | TspMI | XcmI | XmaI |
pCMV-Cre-EGFP中的单酶切位点(Restriction enzymes that cut pCMV-Cre-EGFP)包括:
AccI | GT`MK,AC | 2463 | KasI | G`GCGC,C | 4068 |
AclI | AA`CG,TT | 1047 | MfeI | C`AATT,G | 2821 |
AfeI | AGC|GCT | 660 | MluI | A`CGCG,T | 2957 |
ApaI | G,GGCC`C | 2492 | MscI | TGG|CCA | 4151 |
ApaLI | G`TGCA,C | 5673 | NarI | GG`CG,CC | 4069 |
AsiSI | GCG,AT`CGC | 1133 | NdeI | CA`TA,TG | 240 |
AvaI | C`YCGR,G | 2474 | NheI | G`CTAG,C | 597 |
BamHI | G`GATC,C | 1032 | NruI | TCG|CGA | 891 |
BclI | T`GATC,A | 2728 | PaeR7I | C`TCGA,G | 2474 |
BglII | A`GATC,T | 2468 | PaqCI | CACCTGCNNNN`NNNN, | 1286 |
BmtI | G,CTAG`C | 597 | PflFI | GACN`N,NGTC | 4187 |
BsaI | GGTCTCN`NNN,N | 5058 | PluTI | G,GCGC`C | 4068 |
BsaXI | ,NNN`(N)9AC(N)5CTCC(N)7,NNN` | 3118 | PshAI | GACNN|NNGTC | 1512 |
BsmBI | CGTCTCN`NNNN, | 1360 | PspOMI | G`GGCC,C | 2492 |
BsoBI | C`YCGR,G | 2474 | PstI | C,TGCA`G | 2444 |
BsrGI | T`GTAC,A | 2427 | SacI | G,AGCT`C | 651 |
BssHII | G`CGCG,C | 914 | SalI | G`TCGA,C | 2462 |
CspCI | ,NN`(N)11CAA(N)5GTGG(N)10,NN` | 382 | SfiI | GGCCN,NNN`NGGCC | 3841 |
DraIII | CAC,NNN`GTG | 3184 | SfoI | GGC|GCC | 4070 |
EagI | C`GGCC,G | 3975 | SpeI | A`CTAG,T | 2486 |
Eco53kI | GAG|CTC | 653 | StuI | AGG|CCT | 3890 |
EcoRI | G`AATT,C | 2450 | Tth111I | GACN`N,NGTC | 4187 |
Esp3I | CGTCTCN`NNNN, | 1360 | XbaI | T`CTAG,A | 2480 |
HindIII | A`AGCT,T | 2438 | XhoI | C`TCGA,G | 2474 |
HpaI | GTT|AAC | 2834 | XmnI | GAANN|NNTTC | 885 |
如需对pCMV-Cre-EGFP质粒中插入片段Cre-EGFP进行测序时,推荐使用的正向测序引物T3和反向测序引物T7的序列如下:
T3 primer (620-639): 5' AATTAACCCTCACTAAAGGG 3'
T7 primer (2541-2562): 5' GTAATACGACTCACTATAGGGC 3'
pCMV-Cre-EGFP的全序列信息::D2608 pCMV-Cre-EGFP 全序列.txt
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D2608-1µg | pCMV-Cre-EGFP | 1μg |
D2608-100µg | pCMV-Cre-EGFP | 100μg |
— | 说明书 | 1份 |
-20℃保存。
注意事项:本质粒未经碧云天书面许可不得用于任何商业用途,也不得移交给订货人所在实验室外的任何个人或单位。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。