pCMV-Cre-mCherry是碧云天自行研发的含有CMV启动子的用于在哺乳动物细胞中表达带有mCherry (DsRed的突变体,一种非常明亮的红色荧光蛋白)标签的Cre Recombinase (Cre重组酶)的表达质粒。来自条件性基因敲除(conditional knockout) 小鼠等含有预先插入loxP位点的细胞在转染本质粒后,本质粒表达的Cre Recombinase可以导致两个loxP位点间的基因删除,从而实现条件性基因敲除(conditional gene knockout)。
Cre重组酶是来源于大肠杆菌噬菌体P1的一种类型I的拓朴异构酶(Type I topoisomerase),也是一种酪氨酸重组酶(tyrosine recombinase),它可识别34bp的loxP位点(两端为两个13bp的反向重复序列(inverted repeats),中间是8bp的间隔区(图1)并催化loxP位点之间的DNA发生重组;重组产物根据loxP位点的位置和相对方向的不同而不同,两个含单loxP位点的DNA将发生融合:两个正向重复的loxP位点间的DNA将以环状形式被切割,而两个反向loxP位点间的DNA序列将被翻转(图2)。
图2. Cre-loxP位点特异性重组示意图。
pCMV-Cre-mCherry质粒转染HeLa细胞后的荧光表达效果,可以看到mCherry标签的Cre重组酶主要分布在细胞核中(图3)。
图3. pCMV-Cre-mCherry质粒转染HeLa细胞后的表达效果图。左图为明场照片,中图为荧光照片,右图为叠加照片。
本质粒为卡那霉素抗性,转染细胞后,可使用G418筛选稳定表达目的蛋白的细胞株。
pCMV-Cre-mCherry质粒的主要信息如下:
Feature Nucleotide | Position |
CMV promoter | 1-602 |
T3 promoter and T3 primer binding site | 620-639 |
Cre recombinase | 677-1705 |
mCherry | 1718-2428 |
multiple cloning site | 2340-2488 |
T7 promoter and T7 primer binding site | 2532-2553 |
SV40 polyA signal | 2565-2948 |
f1 origin of ss-DNA replication | 3086-3390 |
bla promoter | 3415-3539 |
SV40 promoter | 3559-3897 |
neomycin/kanamycin resistance ORF | 3932-4723 |
HSV-thymidine kinase (TK) polyA signal | 4724-5182 |
pUC origin | 5311-5978 |
pCMV-Cre-mCherry质粒(6030bp)的图谱如下:
pCMV-Cre-mCherry的详细图谱见说明书:https://www.beyotime.com/Manual/D2607 pCMV-Cre-mCherry.pdf
pCMV-Cre-mCherry中没有的酶切位点(Restriction enzymes that do not cut pCMV-Cre-mCherry)包括:
AflII | AscI | BaeI | BlpI | BmgBI | BsiWI | BspEI |
BspQI | BstXI | BstZ17I | EarI | EcoNI | FseI | NotI |
PmeI | PmlI | PpuMI | PspXI | SacII | SapI | ScaI |
SmaI | SrfI | SwaI | TspMI | XmaI |
pCMV-Cre-mCherry中的单酶切位点(Restriction enzymes that cut pCMV-Cre-mCherry)包括:
AccI | GT`MK,AC | 2454 | Esp3I | CGTCTCN`NNNN, | 1360 |
AclI | AA`CG,TT | 1047 | HindIII | A`AGCT,T | 2430 |
AfeI | AGC|GCT | 660 | HpaI | GTT|AAC | 2825 |
AhdI | GACNN,N`NNGTC | 1911 | MfeI | C`AATT,G | 2812 |
AleI | CACNN|NNGTG | 2360 | MluI | A`CGCG,T | 2948 |
ApaI | G,GGCC`C | 2488 | NdeI | CA`TA,TG | 240 |
AsiSI | GCG,AT`CGC | 1133 | NheI | G`CTAG,C | 597 |
BamHI | G`GATC,C | 1032 | NruI | TCG|CGA | 891 |
BbsI | GAAGACNN`NNNN, | 2153 | PaeR7I | C`TCGA,G | 2465 |
BbvCI | CC`TCA,GC | 2256 | PaqCI | CACCTGCNNNN`NNNN, | 1286 |
BcgI | ,NN`(N)10CGA(N)6TGC(N)10,NN` | 1079 | PflFI | GACN`N,NGTC | 4178 |
BclI | T`GATC,A | 2719 | PflMI | CCAN,NNN`NTGG | 2154 |
BglII | A`GATC,T | 2460 | PshAI | GACNN|NNGTC | 1512 |
BmtI | G,CTAG`C | 597 | PspOMI | G`GGCC,C | 2483 |
BsaI | GGTCTCN`NNNN, | 5049 | SacI | G,AGCT`C | 651 |
BsgI | GTGCAG(N)14,NN` | 2310 | SalI | G`TCGA,C | 2454 |
BsmBI | CGTCTCN`NNNN, | 1360 | SbfI | CC,TGCA`GG | 2069 |
BsrGI | T`GTAC,A | 2418 | SfiI | GGCCN,NNN`NGGCC | 3832 |
BssHII | G`CGCG,C | 918 | SgrAI | CR`CCGG,YG | 2399 |
BtsI | GCAGTG,NN` | 2899 | SpeI | A`CTAG,T | 2478 |
CspCI | ,NN`(N)11CAA(N)5GTGG(N)10,NN` | 380 | Tth111I | GACN`N,NGTC | 4178 |
DraIII | CAC,NNN`GTG | 3175 | XbaI | T`CTAG,A | 2472 |
EagI | C`GGCC,G | 3966 | XcmI | CCANNNN,N`NNNNTGG | 2403 |
Eco53I | GAG|CTC | 653 | XhoI | C`TCGA,G | 2466 |
EcoRI | G`AATT,C | 2442 | XmnI | GAANN|NNTTC | 885 |
如需对pCMV-Cre-mCherry质粒中插入片段Cre-mCherry进行测序时,推荐使用的正向测序引物T3和反向测序引物T7的序列如下:
T3 primer (620-639): 5' AATTAACCCTCACTAAAGGG 3'
T7 primer (2532-2553): 5' GTAATACGACTCACTATAGGGC 3'
pCMV-Cre-mCherry的全序列信息:D2607 pCMV-Cre-mCherry 全序列.txt
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D2607-1µg | pCMV-Cre-mCherry | 1μg |
D2607-100µg | pCMV-Cre-mCherry | 100μg |
— | 说明书 | 1份 |
-20℃保存。
注意事项:本质粒未经碧云天书面许可不得用于任何商业用途,也不得移交给订货人所在实验室外的任何个人或单位。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。