TOPFlash-CP(超灵敏快速降解型报告基因质粒)是用于检测Wnt信号通路中β-catenin介导的TCF/LEF转录活性(Transcriptional activity)快速响应、超灵敏检测的报告基因质粒。本质粒的主要特点是使用了可以被细胞内泛素-蛋白酶体系统(Ubiquitin-proteasome system, UPS)识别并快速降解的luciferase-CP (luc-CP),即包含了泛素化修饰识别序列CP (CL1 and PEST)的luciferase,确保了更低的背景表达和更好的响应性。本产品检测TCF/LEF转录活性水平的灵敏度高于TOPFlash (D2501)。
Wnt信号通路是重要的信号通路之一,与干细胞多能性、胚胎发育、肿瘤的发生等都有着密切的关系。
Wnt信号通路的关键步骤是其关键因子β-catenin的稳定性及是否进入细胞核内,从而决定Wnt信号下游基因的表达。当细胞外缺少Wnt蛋白时,细胞浆内的β-catenin被招募到由APC及Axin等组成的降解复合物上,β-catenin被CK1α和GSK3β磷酸化,从而导致其与E3泛素连接酶β-TrCP的结合并进入泛素化和蛋白酶体依赖的降解途径。因此在非激活状态下,细胞浆内的β-catenin蛋白水平保持着较低的水平,而细胞核内LEF和TCF与Groucho结合抑制了Wnt调控的下游基因表达。当Wnt蛋白结合到受体复合物时,相应的信号通路就被激活。辅助受体LRP可以被CK1α和GSK3β磷酸化,Axin被招募到细胞膜上,因此β-catenin不能被磷酸化而被转运到细胞核内。在细胞核内β-catenin和TCF/LEF形成转录复合物,从而激活了Wnt信号通路下游的基因如c-Myc和cyclin D1等的表达。
TOPFlash-CP是一种超灵敏快速降解型报告基因质粒(Super sensitive and destabilized reporter plasmid),也被称为是快速响应萤光素酶报告基因质粒(Rapid response luciferase reporter plasmid), 是以碧云天的pGL6-TA-CP质粒(D2094)为模板,在其多克隆位点插入两组TCF/LEF结合位点序列,一组为正向序列,另一组是它的反向互补序列,每组有三个重复序列。TCF/LEF转录活性水平与萤光素酶的表达量成正比,从而用于测定细胞内Wnt信号通路的激活水平。
pGL6-TA-CP质粒是用于在哺乳动物细胞中进行萤火虫萤光素酶(Firefly luciferase)报告基因检测的新一代质粒,该报告基因质粒和Promega公司的pGL3系列相比有了全面的改进。一方面对于luciferase的编码进行了改进,确保能更好地在哺乳动物细胞中进行表达;另一方面应用了快速降解型报告基因技术,在luciferase后增加了泛素-蛋白酶体系统识别和降解序列CL1和PEST,合并简称CP,从而可以促进luc-CP在细胞中的降解,降低萤光素酶的本底活性。同时整个质粒中可以被预测出的可能的转录因子结合位点全部进行了适当的突变处理,在保持原有功能不变的情况下,使各种转录因子在质粒上的非特异性结合降到最低。
本质粒中的CP包含针对哺乳动物细胞密码子优化的降解序列hCL1和hPEST。CL1源自酿酒酵母的16个氨基酸序列,可以引导蛋白质通过泛素-蛋白酶体系统降解[1];PEST源自小鼠鸟氨酸脱羧酶(Ornithine decarboxylase) C端的40个氨基酸序列(富含脯氨酸/proline (P)、谷氨酸/glutamic acid (E)、丝氨酸/serine (S)和苏氨酸/threonine (T),PEST),该序列可通过泛素-蛋白酶体系统促进蛋白质的降解[2]。与普通报告基因相比,快速降解型报告基因的背景更低,响应性更好,检测灵敏度更高,更适合监测动态变化过程,例如转录活性的节律变化等。
TOPFlash-CP被广泛应用于Wnt信号通路的研究,FOPFlash-CP (D2504)带有突变的TCF/LEF结合位点序列而作为其阴性对照。
萤光素、萤光素酶、萤火虫萤光素酶和海肾萤光素酶也经常被称作荧光素、荧光素酶、萤火虫荧光素酶和海肾荧光素酶。
TOPFlash-CP质粒的主要信息如下:
Base pairs | 5889 |
TCF binding sites | 20-105 |
Minimal TA promoter (pTA) | 140-171 |
Luciferase reporter gene | 204-1853 |
hCL1 | 1860-1907 |
hPEST | 1911-2030 |
SV40 late poly(A) signal | 2086-2207 |
SV40 early enhancer/promoter | 2401-2758 |
Neomycin | 2789-3583 |
Synthetic poly(A) signal | 3608-3656 |
Reporter Vector primer 4 (RVprimer4) binding region | 3723-3742 |
ColE1-derived plasmid replication origin | 3980 |
Ampicillin | 4771-5631 |
Synthetic poly(A) signal/transcriptional pause site | 5736-5889 |
Reporter Vector primer 3 (RVprimer3) binding region | 5838-5857 |
TOPFlash-CP质粒的图谱如下:
TOPFlash-CP质粒的TCF/LEF结合位点序列见说明书:https://www.beyotime.com/Manual/D2502 TOPFlash-CP(超灵敏快速降解型报告基因质粒).pdf
TOPFlash-CP质粒中没有的酶切位点包括:
Aat II | Asc I | Ase I | Bsa I | BsaA I | BsiW I | BspM II |
BssH II | Eco72 I | EcoR I | EcoR V | Nde I | Nhe I | Nru I |
PaeR7 I | PflM I | Pme I | Pml I | sp1406 I | PspA I | Rsr II |
Sma I | SnaB I | Spl I | Srf I | Tth111 I | Vsp I | Xcm I |
Xho I |
TOPFlash-CP质粒中的单酶切位点包括:
Sfi I | GGCCN,NNN`NGGCC | 8 | EcoN I | CCTNN`N,NNAGG | 3263 |
Bgl I | GCCN,NNN`NGGC | 8 | BstB I | T`CG,AA | 3658 |
Acc65 I | G`GTAC,C | 14 | Sal I | G`TCGA,C | 3672 |
Asp718 | G`GTAC,C | 14 | ApaL I | G`TGCA,C | 4236 |
Kpn I | G,GTAC`C | 18 | Not I | GC`GGCC,GC | 4742 |
Sac I | G,AGCT`C | 110 | BstX I | CCAN,NNNN`NTGG | 4766 |
Mlu I | A`CGCG,T | 112 | BstE II | G`GTNAC,C | 4769 |
Bgl II | A`GATC,T | 118 | Ahd I | GACNN,N`NNGTC | 4844 |
HinD III | A`AGCT,T | 128 | Bsu36 I | CC`TNA,GG | 5200 |
BsrG I | T`GTAC,A | 694 | Pvu I | CG,AT`CG | 5214 |
Gsu I | CTGGAG 21/19 | 1584 | Sac II | CC,GC`GG | 5238 |
Bpm I | CTGGAG 22/20 | 1584 | Bst1107 I | GTA|TAC | 5354 |
Mun I | C`AATT,G | 2216 | Spe I | A`CTAG,T | 5673 |
BamH I | G`GATC,C | 2309 | BsmA I | GTCTC`/9 | 5686 |
Stu I | AGG|CCT | 2742 | BsmB I | CGTCTC 7/11 | 5686 |
TOPFlash-CP质粒中推荐使用的测序引物序列如下:
RVprimer3 (5838-5857): CTA GCA AAA TAG GCT GTC CC
TOPFlash-CP质粒的全序列信息:D2502 pGL6-CP(超灵敏快速降解型报告基因质粒)-序列.txt
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D2502-1μg | TOPFlash-CP | 1μg |
D2502-100μg | TOPFlash-CP | 100μg |
- | 说明书 | 1份 |
-20℃保存。
注意事项:本质粒未经碧云天书面许可不得用于任何商业用途,也不得移交给订货人所在实验室外的任何个人或单位。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。