pGLuc-Dura-miR (报告基因质粒)是碧云天自行研发的一种用于microRNA (miRNA)等研究的分泌型、高稳定性、非ATP依赖的Gaussia-Dura Luciferase (Gluc-Dura)萤光素酶报告基因质粒。该报告基因质粒可用于把目的基因的3'非翻译区(3'-untranslated region, 3'-UTR)或其它适当序列插入到其多克隆位点,然后在哺乳动物细胞中高灵敏度地检测特定microRNA (miRNA)或其它非编码RNA等对该基因3'-UTR或其它靶序列调控活性的报告基因质粒。
pGLuc-Dura-miR以碧云天的pGLuc-Dura质粒为模板,具有氨苄青霉素抗性,并在Gaussia-Dura Luciferase萤光素酶基因之后添加了多克隆位点,便于插入目的基因的3'-UTR或其它适当的靶序列。
pGLuc-Dura-miR的主要工作原理是,把目的基因的3'非翻译区或其它适当序列插入到Gaussia-Dura Luciferase萤光素酶基因的下游,转染细胞并检测Gaussia-Dura Luciferase萤光素酶的表达。如果细胞内源或外源表达的miRNA与靶序列结合,通常会抑制Gaussia-Dura Luciferase萤光素酶的翻译或促进mRNA的降解,从而使Gaussia-Dura Luciferase萤光素酶的表达量减少。因此通过本报告基因质粒检测Gaussia-Dura Luciferase萤光素酶的表达水平,可以检测内源或外源表达的miRNA是否对插入的靶序列有调控作用。并且可以通过靶序列中预测的miRNA结合位点的突变,用于比较突变前后Gaussia-Dura Luciferase萤光素酶表达水平的变化。如果预测的miRNA位点突变后,miRNA的调控作用消失,则基本上说明突变的位点就是miRNA在靶序列中具体的结合位点。
Gaussia Luciferase是分离于夏威夷水域的一种大型海洋桡脚类(Copepod)动物(Gaussia princeps)的新型萤光素酶。Gaussia Luciferase为单条肽链的单体酶,其分子量较小(20kD),且具有分泌性信号肽,可通过内质网分泌到细胞外。因此在使用Gaussia Luciferase的报告基因载体转染哺乳动物细胞进行表达时,无需裂解细胞,可直接使用细胞培养基上清进行萤光素酶活性的实时检测(当然也可以进行细胞裂解以分析细胞裂解中的萤光素酶活性)。
Gaussia Luciferase萤光素酶催化底物腔肠素的氧化反应并且发光(480nm)。与其他萤光素酶相比,使用Gaussia Luciferase作为报告基因有更多的优势:分泌型萤光素酶,可直接取上清检测,无须裂解细胞;发光强度高,是其它萤光素酶的1000倍;反应无须ATP,不受ATP影响;稳定性高,对温度、pH值等耐受性强。
与野生型Gaussia Luciferase相比,突变型Gaussia-Dura Luciferase在哺乳动物细胞中进行表达时,不仅保留了Gaussia Luciferase的优势和特点,还具有更高的蛋白表达水平和更好的萤光稳定性。
pGLuc-Dura-miR带有中低等强度的PGK启动子,有利于检测miRNA等对于Gaussia-Dura Luciferase萤光素酶表达水平的下调作用,即当miRNA的抑制作用较弱时也能检测到。并且PGK启动子可以在人、大鼠、小鼠甚至酵母细胞中都可以发挥作用。
萤光素、萤光素酶、萤火虫萤光素酶和海肾萤光素酶也经常被称作荧光素、荧光素酶、萤火虫荧光素酶和海肾荧光素酶。
pGLuc-Dura-miR质粒的主要信息如下:
Feature Nucleotide | Position |
PGK promoter | 20-538 |
GLuc (MT) reporter gene | 549-1106 |
Multiple cloning region | 1113-1166 |
SV40 late poly (A) sinal | 1173-1417 |
SV40 early enhancer/promoter | 1459-1877 |
Synthetic neomycin phosphotransferase (Neor) coding region | 1903-2697 |
Synthetic poly (A) signal | 2722-2770 |
Synthetic Beta-lactamase (Ampr) coding region | 3885-4745 |
Synthetic poly (A) signal/transcriptional pause site | 4850-5002 |
pGLuc-Dura-miR质粒(5002bp)的图谱如下:
pGLuc-Dura-miR的详细图谱见说明书:https://www.beyotime.com/Manual/D2107 pGLuc-Dura-miR (报告基因质粒).pdf
pGLuc-Dura-miR中没有的酶切位点(Restriction enzymes that do not cut pGLuc-Dura-miR)包括:
AatII | AclI | AflII | AscI | AseI | AsiSI | BsaAI |
BsaI | BsiWI | BsrGI | BssHII | CspCI | DraIII | EcoRI |
NdeI | PacI | PflFI | PflMI | PmeI | PmlI | RsrII |
SbfI | SmaI | SnaBI | SrfI | SwaI | TspMI | Tth111I |
XcmI | XmaI | ZraI |
pGLuc-Dura-miR中的单酶切位点(Restriction enzymes that cut pGLuc-Dura-miR)包括:
Acc65I | G`GTAC,C | 1113 | EcoRV | GAT|ATC | 1134 |
AleI | CACNN|NNGTG | 3877 | FspI | TGC|GCA | 1460 |
ApaI | G,GGCC`C | 1972 | HindII | A`AGCT,T | 1162 |
ApoI | R`AATT,Y | 1265 | HpaI | GTT|AAC | 1320 |
AvaI | C`YCGR,G | 1137 | KpnI | G,GTAC`C | 1118 |
BaeI | ,(N)5`(N)10ACNNNNGTAYC(N)7,(N)5` | 2102 | MfeI | C`AATT,G | 1329 |
BamHI | G`GATC,C | 1126 | MluI | A`CGCG,T | 1150 |
BbvCI | CC`TCA,GC | 2587 | NotI | GC`GGCC,GC | 3855 |
BciVI | GTATCC(N)5,N` | 3237 | NruI | TCG|CGA | 654 |
BglII | A`GATC,T | 1156 | PaeR7I | C`TCGA,G | 1137 |
BsaBI | GATNN|NNATC | 579 | PciI | A`CATG,T | 3035 |
BsaXI | ,NNN`(N)9AC(N)5CTCC(N)7,NNN` | 541 | PsiI | TTA|TAA | 1300 |
BsoBI | C`YCGR,G | 1137 | PspOMI | G`GGCC,C | 1972 |
BspEI | T`CCGG,A | 444 | PspXI | VC`TCGA,GB | 1137 |
BspHI | T`CATG,A | 3755 | PstI | C,TGCA`G | 3875 |
BstBI | TT`CG,AA | 2771 | PvuII | CAG|CTG | 1532 |
BstEII | G`GTNAC,C | 3882 | SacI | G,AGCT`C | 1148 |
BstXI | CCAN,NNNN`NTGG | 3875 | SfiI | GGCCN,NNN`NGGCC | 5 |
BstZ17I | GTA|TAC | 4467 | SgrAI | CR`CCGG,YG | 2122 |
Bsu36I | CC`TNA,GG | 4313 | XbaI | T`CTAG,A | 2700 |
Eco53kI | GAG|CTC | 1145 | XhoI | C`TCGA,G | 1138 |
EcoNI | CCTNN`N,NNAGG | 2376 | XmnI | GAANN|NNTTC | 810 |
pGLuc-Dura-miR质粒可使用的测序引物序列如下:
Feverse primer (998-1015): 5´CGT GCA GTG TTC TGA CCT 3´
Reverse primer (1208-1227): 5´GGT TTG TCC AAA CTC ATC AA 3´
pGLuc-Dura-miR的全序列信息: D2107 pGLuc-Dura-miR (报告基因质粒).txt。
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D2107-1µg | pGLuc-Dura-miR (报告基因质粒) | 1μg |
D2107-100µg | pGLuc-Dura-miR (报告基因质粒) | 100µg |
— | 说明书 | 1份 |
-20℃保存。
注意事项:本质粒未经碧云天书面许可不得用于任何商业用途,也不得移交给订货人所在实验室外的任何个人或单位。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。