FnCas12a,也称为Cpf1,是碧云天自主研发的PerfectProtein™技术平台表达、纯化获得的一种由RNA引导的可编辑DNA的重组核酸内切酶,具有基因编辑效率高,脱靶效率低的优点。FnCas12a来源于Francisella novicida U112, 分子量大约为154kDa。FnCas12a识别含有TTN的PAM序列,并且FnCas12a的切割位点相对远离其识别位点为多次编辑提供了可能性,这些特点使Cas12a与Cas9可以互为补充。只需简单将guide RNA (gRNA)与Cas12a蛋白相结合,由于该gRNA仅含有crRNA,无需trans-activating crRNA (tracrRNA)即可实现基因编辑的目的(图1)。
CRISPR-Cas系统作为原核生物的适应性免疫系统,广泛存在于细菌和古细菌中,能够保护其自身不受外源DNA或RNA的影响,是非常常用的基因编辑工具。完整的CRISPR-Cas系统包括介导识别DNA的CRISPR RNAs (crRNAs)和介导切割DNA的Cas核酸内切酶。
FnCas12a包含约1300个氨基酸,含有RuvC-like结构域,同时具有DNA和RNA内切酶的活性。研究表明,FnCas12a与Cas9由于两者结构的不同导致了其分子机制有所差异[1]。CRISPR-Cas12a系统是由Cas12a和gRNA (crRNA,仅需约40-44个碱基)组成。FnCas12a由gRNA引导至互补链,识别互补链上5'端短的富含T碱基(5'-TTN-3')的PAM (Protospacer adjacent motif)序列,然后FnCas12a中的RuvC核酸内切酶结构域逐个切割互补链和靶链,以产生交错的DNA双链断裂,断裂发生在PAM序列3'端的约第18个碱基处,切割产物为5'端突出4或5个碱基的粘性末端(图1)。而CRISPR-Cas9系统是由Cas9和gRNA (crRNA和tracrRNA两个RNA分子融合而成)组成,Cas9在gRNA的引导下,识别3'端富含G碱基(5'-NGG-3')的PAM序列,并且Cas9需要使用HNH和RuvC两个核酸酶结构域协同切割DNA,断裂通常发生在PAM序列5'端的第3个碱基处,最终产生平末端。
图1.碧云天Cas12a核酸酶序列识别与DNA切割示意图。
基于crRNA效应复合物中的Cas蛋白,CRISPR-Cas系统分为两类。第Ⅰ类CRISPR-Cas系统利用多蛋白效应复合物发挥作用,其可分为3种类型和12种亚型;而第Ⅱ类CRISPR-Cas系统只需用单一的Cas效应蛋白即可对外源核酸序列进行识别和切割,其可分为3种类型和9种亚型。第Ⅱ类CRISPR-Cas系统由于作用机制简单,因此受到广泛关注,其中众所周知的CRISPR-Cas9系统就属于第Ⅱ类2型。本产品与crRNA共同组成了CRISPR-Cas12a系统,该系统则属于第Ⅱ类5型[2]。
FnCas12a (Cpf1)酶的C端融合了核定位信号(Nuclear localization signal, NLS),NLS有助于FnCas12a进入细胞后定位至细胞核,从而提高基因编辑的效率。
碧云天生产的FnCas12a (Cpf1)酶活性检测效果参考图2。
图2.碧云天和N公司的Cas12a酶活性检测对比效果图。20μl水、3μl 10X Reaction Buffer、3μl 300nM gRNA (序列为UAAUUUCUACUAAGUGUAGAUCUGUGUGAAAUUGUUAUCCG)、1μl Cas12a (浓度分别为62.5、125、250、500、1000nM,加入体系后的终浓度为2.08、4.17、8.33、16.67、33.33nM),在25℃预孵育10min。然后加入3μl 30nM的pUC18质粒DNA形成30μl反应体系,在37℃孵育10min。加入1μl蛋白酶K,室温孵育10min以终止反应。最后加入6μl DNA上样缓冲液(6X) (D0071),进行电泳检测。gRNA与Cas12a结合后,将引导后者至pUC18的第479bp处产生酶切,超螺旋的pUC18质粒被Cas12a酶切后产生线性化的pUC18,迁移率变慢。如图2所示,本产品与N公司的Cas12a具有相近的酶活性。实际效果会因样品、具体实验条件等的不同而存在差异,本图仅供参考。
来源:由大肠杆菌表达,表达基因的来源为FnCas12a。
用途:可用于基因编辑和基因检测等。线粒体或质粒DNA等双链环形DNA的线性化。
纯度:不含DNA内切酶和外切酶,不含RNA酶。
浓度:1μM (153.7ng/μl )。
酶储存溶液:500mM NaCl, 20mM Sodium acetate, 0.1mM EDTA, 0.1mM TCEP, 50% (v/v) Glycerol, pH6 @25℃。
10X Reaction Buffer: 500mM NaCl, 100mM Tris-HCl, 100mM MgCl2·6H2O, 1mg/mL BSA, pH7.9 @25℃。
失活或抑制:65℃加热10分钟失活。
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D0510S-1 | FnCas12a (1μM) | 100μl |
D0510S-2 | 10X Reaction Buffer | 0.5ml |
- | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D0510M-1 | FnCas12a (1μM) | 500μl |
D0510M-2 | 10X Reaction Buffer | 2ml |
- | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D0510L-1 | FnCas12a (1μM) | 2ml |
D0510L-2 | 10X Reaction Buffer | 8ml |
- | 说明书 | 1份 |
-20℃保存,至少两年有效。
注意事项:本产品使用过程中需要确保Nuclease-free,操作时应特别小心,避免被污染。所有操作都需要按照RNase-free的要求进行。
对于操作环境中核酸酶的去除,推荐使用碧云天生产的RNase and DNase Away (R0123)以去除实验桌面上或其它接触面上的核酸酶。反应体系中推荐加入RNase Inhibitor以保护RNA不被降解。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
Reagent | Volume |
Nuclease-free water | 20µl |
10X Reaction Buffer | 3µl |
gRNA (300nM) | 3µl |
FnCas12a (1μM) | 1µl |
Total Reaction Volume | 27µl |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D0508S | 基因组编辑突变检测试剂盒 | 25次 |
D0508M | 基因组编辑突变检测试剂盒 | 100次 |
D7080S | T7 Endonuclease I (CRISPR等基因突变鉴定用) | 250U |
D7080M | T7 Endonuclease I (CRISPR等基因突变鉴定用) | 1250U |
D7080L | T7 Endonuclease I (CRISPR等基因突变鉴定用) | 5000U |
ST532 | Proteinase K (20mg/ml) | 0.2ml |
R0123 | RNase and DNase Away | 250ml |
R0102-2kU | RNase Inhibitor | 2000U |
R0102-10kU | RNase Inhibitor | 10000U |
R0102-50kU | RNase Inhibitor | 50000U |
D0509S | Cre Recombinase | 50U |
D0509M | Cre Recombinase | 250U |
D0509L | Cre Recombinase | 1000U |
ST876-100ml | BeyoPure™ Ultrapure Water (DNase/RNase-Free, Sterile) | 100ml |
ST876-500ml | BeyoPure™ Ultrapure Water (DNase/RNase-Free, Sterile) | 500ml |
D7062 | SP6 RNA Polymerase | 500U |
D7066 | T3 RNA Polymerase | 500U |
D7069 | T7 RNA Polymerase | 1000U |
D7383 | NTP set (100mM each, Nuclease free) | 4×250μl |