类似于表观遗传学中DNA和组蛋白修饰,表观转录组学修饰(RNA修饰)在真核生物发育过程中已被证明是重要的调控因子。迄今为止,已经确定了超过170种不同类型的化学修饰作用于RNA核碱基上。其中RNA甲基化是最主要的也是研究最为广泛的RNA修饰,包括m6A、m3C、m1A、m1G和m22G等。
从PubMed的检索结果分析来看(见图1),自1959年第一篇与RNA甲基化相关的文献发表以来,到2000年左右,相关成果一直表现平平,随后一路高涨,仅2022年相关发表成果就达到了2784篇之多!这种高速发展与各种RNA甲基化相关研究产品的商业化在一定程度上具有很大的关系!其中最重要的商业化产品无异于甲基化研究的核心产品AlkB了!与RNA甲基化相关成果趋势一致,2000年后,AlkB相关文献一路飙升(见图2),其中不乏见于Nature(21篇)、Cell(24篇)、Science(6篇)主刊!其与RNA甲基化相关的重要性可见一斑!目前,碧云天不仅提供有野生型的商业化AlkB (RNA/DNA去甲基化酶, Nuclease-free), 更是国内外率先(很可能是独家)提供商品化的能更有效去除N1-methylguanosine (m1G)甲基化修饰的突变体AlkB (D135S) (RNA m1G去甲基化酶, Nuclease-free)和更有效去除N2-dimethylguanosine (m22G)甲基化修饰的突变体AlkB (D135S/L118V) (RNA m22G去甲基化酶, Nuclease-free),通过对比三款酶的处理结果,助力您更方便有效地解析RNA甲基化修饰!
图1.RNA甲基化发表文献数量统计(图源:PubMed官网)。
图2.AlkB相关发表文献数量统计(图源:PubMed官网)。
碧云天三种商品化AlkB对比
产品名称 | 突变类型 | 特点 | 用途 |
AlkB(RNA/DNA去甲基化酶, Nuclease-free) | 野生型 | 可以有效地修复单链或双链DNA和RNA中的各种烷基化损伤(Alkylation damage),常被用于去除RNA中的m6A等甲基化修饰,去除DNA中的m1A、m3C、m6A等修饰,并进一步用于后续的qPCR或高通量测序分析。 | RNA的m6A、m1A、m3C或m1G去甲基化;ARM-seq、PANDORA-seq等;DNA的m1A、m3C和m6A的去甲基化。 |
AlkB(D135S) (RNA m1G去甲基化酶, Nuclease-free) | AlkB第135位天冬氨酸(Asp, D)突变为丝氨酸(Ser, S)的突变体 | 比野生型AlkB能更有效地去除转运RNA (tRNA)中的N1-methylguanosine (m1G)甲基化修饰,并可进一步用于后续的qPCR或高通量测序分析。 | tRNA的m1G去甲基化;DAMM-Seq、ARM Seq、PANDORA-seq以及DM-TGIRT-seq、CPA-seq等。 |
AlkB(D135S/L118V) (RNA m22G去甲基化酶, Nuclease-free) | AlkB第135位天冬氨酸(Asp, D)突变为丝氨酸(Ser, S)并将第118位亮氨酸(Leu, L)突变为缬氨酸(Val, V)的突变体 | 比野生型AlkB能更有效地去除转运RNA (tRNA)中的N2,N2-dimethylguanosine (m22G)甲基化修饰,并可进一步用于后续的qPCR或高通量测序分析。 | tRNA的m22G去甲基化;DAMM-Seq、ARM Seq、PANDORA-seq以及DM-TGIRT-seq、CPA-seq等。 |
产品效果
图3. 碧云天生产的AlkB(R0639)对HEK 293T细胞总RNA的m6A修饰的去甲基化效果图。实验结果显示,4µg的HEK 293T细胞总RNA用4U碧云天的AlkB蛋白37℃孵育处理100min后,可以充分去除其中的m6A甲基化。
产品特点
纯度高:不含DNA内切酶和外切酶,不含RNA酶,不含磷酸酯酶。避免RNase对RNA的高通量测序等带来负面影响;
产品齐全:拥有野生型的商业化AlkB (RNA/DNA去甲基化酶, Nuclease-free)、国内外首家商品化的突变型AlkB(D135S) (RNA m1G去甲基化酶, Nuclease-free)和AlkB(D135S/L118V) (RNA m22G去甲基化酶, Nuclease-free),全方位助力RNA甲基化研究!
性价比高:由碧云天自主研发的PerfectProtein™技术平台通过大肠杆菌表达、纯化获得,超高性价比。
产品信息
产品编号 | 产品名称 | 包装 | 产品价格 |
R0639S | AlkB (RNA/DNA去甲基化酶, Nuclease-free) | 200U/1000U/5000U | |
R0639M | AlkB (RNA/DNA去甲基化酶, Nuclease-free) | 200U/1000U/5000U | |
R0639L | AlkB (RNA/DNA去甲基化酶, Nuclease-free) | 200U/1000U/5000U | |
R0641S | AlkB (D135S) (RNA m1G去甲基化酶, Nuclease-free) | 50U/250U/1250U | |
R0641M | AlkB (D135S) (RNA m1G去甲基化酶, Nuclease-free) | 50U/250U/1250U | |
R0641L | AlkB (D135S) (RNA m1G去甲基化酶, Nuclease-free) | 50U/250U/1250U | |
R0643S | AlkB (D135S/L118V) (RNA m22G去甲基化酶, Nuclease-free) | 50U/250U/1250U | |
R0643M | AlkB (D135S/L118V) (RNA m22G去甲基化酶, Nuclease-free) | 50U/250U/1250U | |
R0643L | AlkB (D135S/L118V) (RNA m22G去甲基化酶, Nuclease-free) | 50U/250U/1250U |